错过了信号?这是我们在生物学上彼此不同的一种新方式

错过了信号?这是我们在生物学上彼此不同的一种新方式
缺失信号:在等位基因2中,血液相关基因(红星)的DNA增强子发生突变,阻止信号转录因子与之结合。这阻止了信号通过,因此血液基因不能最佳地打开。随着时间的推移,未能对信号做出反应会改变一个人的红细胞再生能力,特别是在压力条件下,如感染或化疗,例如。资料来源:波士顿儿童出版社Avik Choudhuri

遗传学在过去20年里取得了巨大的进步,从人类基因组测序到对基因开启和关闭的因素(即转录因子和它们结合的DNA“增强子”序列)的理解不断加深。波士顿儿童医院的一项新研究介绍了人类遗传学的另一个未知层面。它发现基因对外界化学信号反应能力的遗传变异。

这项研究发表在今天的《科学》杂志上自然遗传学他的研究重点是红细胞性状的遗传变异。但是波士顿儿童医院干细胞研究项目主任Leonard Zon医学博士认为,这些发现适用于身体的任何组织或器官。它们可能有助于解释为什么有些人或多或少会受到疾病的影响,为什么器官的功能不同,以及为什么有些人对药物的反应比其他人更强烈。

Zon说:“我们发现,人类基因决定了一个细胞是否会对一个外部信号做出反应,这是基于基因到基因的基础上的。”Zon同时也是Dana-Farber/波士顿儿童癌症和血液疾病中心、霍华德休斯医学研究所和哈佛干细胞研究所的成员。“我们相信许多遗传条件是由于这一反应的缺陷——一种‘信号病’。”

当DNA增强子无法接收信号时

佐恩和他的团队使用了最近发表的数据(GWAS)。这些研究扫描了大量人的基因组,以发现与某种特征或疾病相关的遗传变异。在这种情况下,研究小组找出了与7种红细胞特征相关的遗传变异,如红细胞大小和血红蛋白浓度。

事实证明,许多与这些特征相关的变异会映射到一小部分基因增强子上。这些增强子与两种类型的基因调节因子结合:主转录因子负责调节血细胞的生成,信号转录因子负责协调细胞外部信号的反应。

当Zon和他的同事在实验室观察血细胞祖细胞时,他们发现许多变异改变了信号转录因子结合的增强子的DNA序列。他们表示,这阻止了这些因子与增强子的结合。这个缺失的信号阻止了邻近的基因打开-在正常情况下,它会在红细胞成熟的信号下打开。

“这一编码的突变将信号因子从DNA中剔除,因为它没有AAvik Choudhuri博士说,他是这项研究的第一作者,也是哈佛大学干细胞和再生生物学(HSCRB)的一员。这使得一个重要的血液基因周期性地对信号没有反应。随着时间的推移,这种异常反应,尤其是在压力下,会导致组织损伤和疾病。”

更好地理解人类特征

GWAS研究已经将许多性状与DNA增强子序列的变化联系起来。但还没有人证明性格特征会因为信号传递失败而改变。

佐恩说:“这在以前是不为人知的。“如果我们想更好地理解人类变异,我们必须在基因组中,在每个组织中找到那些接受细胞外转录信号的区域。每个人的单个基因所能发出的信号量各不相同。”

这项研究严重依赖于全基因组数据的计算分析。“观察这种与模式特征相关的变异,尤其是影响信号的DNA着陆点第一作者布莱恩·亚伯拉罕博士说,他就职于怀特海德生物医学研究所,目前就职于圣裘德儿童医院。ob欧宝直播nba

新的治疗目标?

展望未来,佐恩相信该团队的工作将开辟新的治疗机会。他设想对特定基因、增强子以及增强子上化学信号结合的位置进行计算分析。这样的分析可以预测哪种特定的细胞类型最有可能“听到”哪些信号,从而指导药物的选择。佐恩于2018年联合创立了CAMP4 Therapeutics公司,专注于通过这种测绘发现药物。

佐恩推测:“你只需看一下DNA密码,就知道该给什么药。”“如果一个突变关闭了一个信号结合位点,你或许可以通过发送不同的信号来拯救疾病。”

或者,科学家可以设计治疗方法,改变增强子DNA本身,使其能够接收接收到的信号,或者治疗方法,打开增强子独立于增强子通路,佐恩说。


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更多信息:Avik Choudhuri等人。信号转录因子结合位点的常见变异驱动红血球性状的表型变异,自然遗传学(2020)。DOI: 10.1038 / s41588 - 020 - 00738 - 2
期刊信息: 自然遗传学

引用:错过了信号?《我们在生物学上彼此不同的新方式》(2020年12月22日)从//www.puressens.com/news/2020-12-vary-biologically.html检索到2020年12月22日
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