受数据仓库的启发:一种集成不同信息系统的新平台

学术医疗中心不断努力加强患者护理。改善患者健康结果的主要机制之一是通过翻译研究 - 通过临床试验从实验室到患者的研究突破。使临床试验更有效，最终更成功，将显着提高患者护理。然而，实施改进翻译科学所必需的相关数据的破碎是一个重要的障碍。

虽然一些生物信息学工具试图解决这个问题，但它们往往缺乏评估转化科学效率的能力。南卡罗来纳临床和转化研究(SCTR)研究所是临床和转化科学奖(CTSA)的中心，其学术中心位于南卡罗来纳医科大学(MUSC)，该研究所的研究人员开发了一种新的生物信息工具，称为RINS，即研究综合系统网络，这可以用来评估临床试验过程的改进是否产生了影响。他们的研究结果于3月17日在线发表在美国医学信息学协会杂志，表明RINS可以整合跨不同系统的临床研究数据，并提供有关MUSC临床试验效率和有效性的指标。

“你可以称它为元数据——它是关于我们如何在研究中产生数据，或者我们如何使研究启动、运行和加速它们的数据，”MUSC的首席研究信息官、生物医学信息学中心(BMIC)主任Leslie A. Lenert医学博士说。“这些都是在不同的地方，以不同的形式，使用的数字没有一个公认的定义。但我们把所有这些都放在一个角度来全面了解做科学的过程。我们以前从未有过这样的情况，因为数据存在于完全不同的系统中。”

要做出关于如何最好地改进和简化转化研究实践的明智决定需要详细的数据，而为了积累这些数据，机构需要强有力的评估工具。为此，MUSC开发并使用了一个研究事务管理系统SPARCRequest，它提供了一个强大的工具，帮助研究人员确定拨款申请的预算，导航监管程序，招募不同的研究参与者和进行临床试验。作为一个开源平台，SPARCRequest被12个CTSA和临床和翻译研究(CTR)中心所利用，这些中心包括全国27个机构。

虽然SPARCRequest在简化临床研究方面发挥了重要作用，但它最初并不是为了跨不同系统的度量跟踪而设立的。为了解决这个问题，Lenert找到了SCTR的首席运营官Royce R. Sampson，他也是SPARCRequest的发明者之一，提出了创建一个研究数据集市的想法。Lenert设想的数据集市，将Sampson已经通过SPARCRequest领导的研究指标跟踪活动提升到了一个新的水平，并实现了跨学科的小组跟踪和沟通。

BMIC研究数据集市的数据库管理员Katie G. Kirchoff说:“研究数据集市是一个数据仓库，它将来自多个系统的数据集成到一种格式中，使得从不同系统返回指标和分析更容易。”

“这是一个简单的概念，但难以执行，”Lenert，谁也是数据科学和信息学的助理竞争。“没有人有机会汇集这些不同的系统，告诉我们制度审查委员会议定书获得批准的多长时间，或者这笔资金是否导致那些结果 - 这些是难以做到的事情。”

为了在仓库中存放和访问数据，RINS团队需要一种方法来唯一地识别每个研究并将不同的系统连接在一起。为了解决识别每个研究的问题，该团队创建了一个研究主标识符(RMID)。

Sampson说:“RMID帮助我们有了一个标准化的协议编号系统，这样我们就可以将我们内部的系统连接起来。”“RINS是一个平台，我们把所有的东西放在一起。”

通过开发应用程序编程接口(api)，可以将各个系统连接在一起。这些api将系统连接在一起，并使数据几乎实时地跨系统进行更新。

使用RMID和API，Rins将SparcRequest与其他电子数据库集成，包括MOSC的电子健康记录;电子机构审查委员会;和授予奖励管理，支出跟踪和临床试验管理的系统。rins已经足够灵活地容纳新程序，同时也保持历史数据。

作为一个新的数字数据仓库，Rins为监控翻译科学数据提供了两个关键改进。第一个改进是将不同系统集成到一个平台上。这允许更完整的研究流程图片，并确定临床试验的成功和挑战。

第二种改进是使用分散系统。大多数平台使用集中系统，该系统需要每个研究管理领域采用已集成到集中解决方案的任何系统，即使它不是最适合其需求的系统。相比之下，rins是一个分散的系统，使每个组能够在保持全面的集成报告的同时使用其首选系统。这允许临床研究例如在系统上被跟踪，以便更清楚地了解项目生命周期的想法，为翻译努力的影响提供了衡量标准，并确定了改善临床试验效率的领域。

该报告的主要作者、SCTR系统工程师何文军(Wenjun He)说，“我们不是试图建立一个满足所有需求的系统，但我们实际上是在利用现有的系统，并将它们连接起来以满足报告需求。”“我们可以随时将其扩展到校园周围的任何新系统——这是一个无缝的过渡。”

随着越来越多的机构关注他们的项目如何运行，以及越来越多的资助机构需要绩效数据，机构可能会向RINS寻求帮助。虽然RINS是MUSC的一个开源平台，但其他机构很难像现在这样采用这个平台。

“此时，它定制了我们利用的系统，”研究Web解决方案总监Andrew M. Cates说。“可以进行新的集成，但另一个机构无法开始使用它，而无需进行一些自定义或具有与我们在Musc的内容类似的系统。”

尽管目前不是所有机构都可以使用，但RINS已经引起了SPARCRequest开源联盟的兴趣，并可能帮助这些机构过渡到更好的度量监测。因为许多这样的机构已经使用了SPARC，所以通过RINS整合更广泛的系统对它们来说可能更容易。

通过广泛的系统协作有助于确保这一点临床试验顺利有效地运行。通过诸如RINS等工具和丰富的服务和资源，SCTR支持研究人员进行有效的研究。

“目标是提高审判和研究团队的绩效，并删除临床研究的障碍和挑战，”桑普森说。“SCTR每年提供900多个咨询，服务和资源来支持和教育学习团队。rins使我们能够在机构层面识别机会。”

总的来说，RINS是一个提取转译科学关键数据的强大工具。RINS集成数据临床研究跨不同的系统，并提供分析，可用于改善临床试验过程。临床研究办公室一直是RINS不可或缺的、关键的和主要的利益相关者，在他们的持续支持下，RINS的未来可以纳入基础科学的数据，为授予研究经费、核心设施和突破性科学提供新的数据。

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