为什么非洲裔巴西人更难找到骨髓捐赠者

为什么非洲裔巴西人更难找到骨髓捐赠者
根据发表在《免疫学前沿》上的一项研究,原因是他们的基因异质性和在巴西骨髓库中缺乏比例代表。信贷:•迪奥戈迈耶

一个多学科科学家团队的一篇论文表明,与欧洲血统的人相比,非洲血统的人在国家自愿骨髓捐赠者登记(REDOME)中找到捐赠者的可能性更低,该团队隶属于São保罗大学(USP)和国家癌症研究所(INCA)等多个巴西机构。这篇论文发表在免疫学前沿

REDOME是世界第三大骨髓库,拥有超过500万注册自愿捐赠者。

根据这项研究,具有主要非洲遗传血统的人找到捐献者的几率会降低60%,而拥有非洲的HLA基因副本(必须与捐献者的基因兼容才能进行移植)可以降低75%。

根据这项研究,随着非洲血统程度的增加,在REDOME上找到匹配的可能性降低。研究还讨论了作者所认为的,根据国家人口普查局(IBGE)使用的分类,自我认同与实际遗传血统之间的弱相关性。他们写道,IBGE的分类“只解释了一小部分”人类的祖先。

“就预测影响移植的基因(即免疫功能基因)而言,这种分类是粗略的,但REDOME公司使用了这种分类。捐赠者在填写登记表时必须选择其中一个类别。就免疫功能基因而言,一个人可以是非洲人或欧洲人的祖先,但‘黑’、‘棕’和‘白’这些标识符并不符合这些类别,”USP专门从事免疫功能基因研究的教授迪奥戈·迈耶(Diogo Meyer)说他是这项研究的主要研究员。

研究得出的结论是,那些自认为是“preto”(黑人)或“pardo”(棕色皮肤,即混血)的人找到捐赠者的可能性比那些自认为是“branco”(白人)的人低57%。

HLA ()免疫功能基因与抗原结合,包括细胞代谢的潜在毒性残留物或入侵病原体的片段。t细胞是免疫系统的重要组成部分,可以区分机体产生的抗原和入侵者。当HLA分子与未被识别的抗原结合时,就会触发免疫反应。因此,受体和供体之间的完美匹配对于避免排斥反应和确保干细胞移植成功至关重要。

梅耶解释说,非洲裔巴西人很难找到配偶有几个原因。他们在REDOME中没有按比例代表,因为REDOME使用了不精确的种族分类。他们在基因上比其他人口更加多样化和异质化,两个没有血缘关系的非洲人不太可能拥有完全相同的hla,因为人类迁徙始于非洲。参加这次旅行的人只携带了一部分现有的变异。

这篇论文的第一作者是USP的博士后生物学家Kelly Nunes,他认为只有非洲血统的MHC区域能降低75%的找到捐献者的几率。MHC代表主要组织相容性复合体,是一组帮助免疫系统识别外来物质的基因。它包括HLAs。

“自我认同为‘preto’预示着这个人的基因组中有非洲基因祖先。这包括免疫功能基因,这是在移植的情况下很重要的,”迈耶说。“不过,这是一条经验法则,也有例外,特别是在像巴西这样高度混合的人口中,一个自称‘preto’的人携带欧洲HLA基因并不罕见。事实上,在REDOME中,为非洲患者提供捐赠的捐赠者可能自我认同为“branco”。然而,我们在人口样本中发现的非洲基因个体越多,黑人捐赠者的比例就越大。”

梅耶强调,这一结果并不意味着黑人没有机会在REDOME中找到捐赠者。“我们比较了不同祖先的匹配概率。在实际的移植案例中,HLA分型必须有很高的精确度,捐赠者必须身体健康,并有仔细分析的基因型,以确保他们真正兼容。每一步都减少了移植发生的机会。”

染色体的组合

据迈耶说,许多问题仍未得到解答。他说:“到目前为止,我们还没有解决的一个问题是,有非洲血统的巴西人很难找到捐赠者的原因是他们有非洲染色体,还是他们有非洲和欧洲基因的混合。”“欧洲和非洲的部分可能在REDOME中有体现,但两者结合可能是罕见的,可能有数千种这样的组合。”

根据迈耶的说法,该团队还不能回答关于混合和非洲血统比例在多大程度上阻碍匹配的问题。“这两件事有点不同。我们所知道的是,平均而言,拥有非洲HLA基因的人比拥有欧洲血统的人面临更多的困难。”“欧洲和非洲染色体的组合是否也能降低配对的概率,还有待观察。”

此外,在巴西,“非洲人”一词可以指来自非洲不同地区的人。迈耶说:“我们可能正在研究只存在于巴西的基因型——一种与非洲大陆不同地区有关的祖先的混合。”“所有这一切都取决于REDOME中所代表的东西,因为我们没有从遗传的角度描述存储库。我们只有‘preto’、‘branco’和‘pardo’这样的标签。”

方法和抽样

该小组由人类健康、生物学、统计学和计算领域的科学家组成,使用两个巴西队列作为样本:受体流行病学和捐助者评估-巴西镰状细胞病(REDS-III Brazil SCD);EPIGEN-Brazil是拉丁美洲人口基因组学和遗传流行病学计划的一部分。

从前者中,他们从四个机构中招募了2,703名镰状细胞病患者:三个血库(Fundação贝洛奥里藏特、Juiz de Fora和蒙特斯克拉罗斯的血库;Fundação累西腓的血球;Fundação Hemorio in里约热内卢de Janeiro);儿童医院研究所das Clínicas,这是São保罗大学医学院(fem - usp)经营的教学和综合医院。

在EPIGEN-Brazil队列研究中,来自萨尔瓦多(巴伊亚州)、Bambuí(米纳斯吉拉斯州)和佩洛塔斯(里约热内卢大南州)的5334名个体被纳入研究样本。

梅耶说:“样本不是骨髓移植等待名单上的人。“这是一个由祖先已知的个体组成的方便样本。”然而,对于那些患有镰状细胞病的人,研究结果可以预测未来的情况。“大多数患有这种疾病的人都是非洲人后裔,骨髓移植有望得到治疗,所以这些人将来可能会从这种干预中受益。”

对超过8000个个体的基因型进行实验室分析成本太高,因此研究人员使用了一种叫做基于snp的HLA imputation技术。“我们的基因组结构让我们做出预测。基因组中一个位置的突变可以预测另一个位置的突变,因为我们以染色体位的形式传递遗传物质。这些片段被重新组合,但不会像在搅拌机中一样融合:有一定的逻辑,使统计学家和遗传学家能够开发一种算法,通过他们物理附近的突变来预测一个人的hla,”迈耶解释说。

用来推断遗传祖先的软件被输入了巴西人口中各种族中基因变异发生频率的数据。

下一个步骤

根据研究人员的说法,研究结果支持了这样一个想法:如果REDOME希望具有代表性,并确保公平地获得非洲人后裔,它就必须有更多的非洲血统的捐赠者。“然而,如果非洲裔和欧洲裔的配对次数一样多,那么非洲裔在REDOME中所占的比例可能就有必要大于欧洲裔在总人口中的比例,因为他们在抽样方面更‘苛刻’。”

研究人员现在计划找出非裔巴西人是否很难找到一个因为非洲染色体在REDOME中很罕见,或者因为与欧洲染色体的混合产生了难以定位的组合。迈耶说:“我们还想进行一项进化定量研究,以调查世界不同地区MHC的亲缘关系。换句话说,要找出两个欧洲人比两个非洲人的平均亲缘关系要密切多少。”


进一步探索

遗传变异与非裔美国儿童癌症幸存者的心脏健康有关

更多信息:Kelly Nunes等人,祖先如何影响找到不相关捐赠者的机会:对混合巴西人的调查,免疫学前沿(2020)。DOI: 10.3389 / fimmu.2020.584950
所提供的FAPESP
引用:为什么非洲裔巴西人更难找到2021年5月26日从//www.puressens.com/news/2021-02-harder-brazilians-african-descent-bone.html获得的骨髓捐赠者(2021年,2月2日)
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