研究人员建立了头颈部癌症的综合数据库

据信，这是迄今为止对最常见的头颈部癌症类型进行的最全面的分子表征，来自约翰霍普金斯大学医学院病理和肿瘤系、约翰霍普金斯大学金梅尔癌症中心的研究人员表示，美国和波兰的其他18个研究中心已经阐明了关键的癌症相关基因、蛋白质和信号通路在这些癌症中的作用，同时提出了可能的新的治疗途径。

他们对hpv阴性的头颈部进行了深入调查鳞状细胞癌（HNSCCS），在1月7日期刊中描述了癌细胞这些肿瘤来自108名尚未接受治疗的患者癌症治疗，以及肿瘤周围的66个健康组织样本。该研究系统地编目了hpv阴性的hnscc相关蛋白、磷酸盐(被修饰的区域)磷酸基)和信号通路，发现了三种不同的HNSCCs亚型。

头颈部鳞状细胞癌起源于上呼吸道的细胞，包括嘴唇、嘴巴、舌头、鼻子、喉咙、声带以及部分食道和气管。研究人员发现的头颈部鳞状细胞癌的第一种亚型，称为CIN，预后最差。它与喉部、强烈的吸烟史和染色体高度不稳定有关。因为这种亚型与CCND1和CDKN2A基因的频繁畸变以及CDK4和CDK6酶的高活性有关，这种类型的癌症可能对其反应最好抗癌药物叫CDK4/6抑制剂。

第二种被称为基型，显示了几个基型因子的蛋白升高，这是激活基因转录所需的最基本的一组蛋白。其特征是表皮生长因子受体(epidergrowth factor receptor, EGFR)信号通路的高活性和附着在EGFR上的AREG和TNFA分子的高表达肿瘤蛋白质。因此，研究人员说，这些癌症可能最佳响应抗癌药物，称为单克隆抗体，其目的是EGFR。

在没有吸烟的人的肿瘤中发现了第三个亚型，称为免疫力，并且显示出高表达多种免疫检查点蛋白。研究人员称，这些肿瘤可能最佳地应对抗癌药物，称为免疫检查点抑制剂。总体而言，32％的CIN肿瘤，基础肿瘤的62％和83％的免疫肿瘤具有很高的建议治疗潜力。

研究人员还发现了EGFR激活的两种模式，提出了一种基于结合EGFR的分子数量来分层头颈部鳞状细胞癌的新策略，这是利用自然免疫系统对抗癌症的单克隆抗体药物的有效治疗。此外，他们指出，这些癌症中免疫调节基因的广泛缺失导致了产生免疫反应能力的丧失。

“该研究扩展了我们对HPV阴性HNSCC的生物学理解，并产生治疗假设，可作为未来研究和临床试验对分子指导精确药物治疗这种侵略性的基础癌症型号，“丹尼尔陈，博士，博士，院长，病理学和肿瘤教授，以及约翰霍普金斯大学医学院的生物标志物发现和译文中心主任。

这三个亚型和建议的治疗“是相当重大的调查结果”，惠章，博士，博士，研究，病理学教授，肿瘤教授，大约约翰霍普金斯大学学校的大众光谱核心设施主任医学。“以前，患者将使用不同的选择治疗，但没有系统的方式来了解某些患者的最佳选择。”她说，该团队已开始挑逗HPV阳性HNSCCS的属性。

研究人员使用了最先进的基因组和蛋白质组学技术来梳理出头颈细胞癌的蛋白质基因组学特征，定义为基因组成(基因组学)、DNA的化学修饰(表观基因组学)、位于细胞内的信使RNA(转录组学)、蛋白质(蛋白质组学)及其磷酸基团修饰(磷酸蛋白质组学)，一种已知的调节修饰蛋白质通过打开或关闭来函数。该工作已完成，作为国家癌症研究所的临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CPTAC）的一部分，是通过蛋白质组织更好地了解癌症的国家努力。

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