2019年7月26日,

对于沙门氏菌的检测，基因组工具是一个关键

随着食品工业转向高分辨率的全基因组测序，世界食品供应将变得更加安全。全基因组测序可以一次性检测给定生物体的全部DNA。这项使基因测序无处不在的举措将导致沙门氏菌始终可靠的检测。

在杂志上发表的论文微生物学前沿这份由康奈尔大学和玛氏全球食品安全中心(GFSC)的研究人员共同撰写的报告揭示了一些突破。

沙门氏菌是一种食源性病原体，对全球公共卫生和经济影响最大。这是导致世界各地腹泻的主要原因之一。”食物安全教授，康奈尔食品系统研究所研究员。沙门氏菌可能是轻微的，也可能导致死亡，其严重程度取决于情况沙门氏菌血清型[明显的变异]，这就是我们想要找出的。”

这篇论文描述了世界各地的食品工业应该如何更频繁地使用分子方法对沙门氏菌进行分型和特征分析。这篇论文将较早的分型实践(有些实践可以追溯到20世纪30年代)与较新的全基因组测序进行了比较，全基因组测序是一种可以分析更广泛、更完整基因组的方法。

Wiedmann说，有了这项技术，科学家可以更精确地识别一种特定的沙门氏菌株，并确定疾病爆发的来源和途径。

例如，7月初，美国食品和药物管理局和联邦疾病控制和预防中心(CDC)使用了这种技术，他们开始调查猪耳狗食物和人类之间的可疑沙门氏菌联系——由于人们处理这些食物。美国疾病控制与预防中心的数据显示，当时美国13个州共有45例沙门氏菌感染病例，其中12人住院治疗。

“全基因组测序正在迅速成为沙门氏菌亚型的选择方法，”该论文的第一作者、玛氏全球食品安全中心的高级研究科学家唐思林(Silin Tang)说。“食品往往通过日益复杂的供应链到达消费者手中，这就创造了许多可能危及食品安全的机会。最近的案例凸显了加强食品行业沙门氏菌控制措施的必要性，包括使用适当的分型工具快速准确地追踪污染源。”

唐家璇说，这是一个机会食品行业利用软件工具来理解生物数据，从而建立生物信息学专业人才的管道，充分发挥生物信息学的潜力全基因组测序技术。