一个数学水晶球凝视前列腺癌治疗的未来

Copotherapy Docetaxel被广泛接受为转移阉割抗阉割前列腺癌的标准治疗。但10-20％的患者将产生不良副作用，即强制停止治疗。这些患者在首先用另一种治疗或替代剂量的多西紫杉醇进行了更好的患者，但在尝试患者继续经历衰弱的副作用之前，谁可以知道？众群竞争被认为是一个开放的问题。今天在这一点临床肿瘤临床癌症信息学杂志CHINESE国际研究团队利用以前进行的四项临床试验的公开数据，设计了预测患者因不良事件而停止多西他赛治疗的可能性的数学模型。这些结果代表了首次基于患者临床特征做出此类预测的综合努力。

具体而言，挑战是将129个基线临床测量中的任何一个连接到机会多西紫杉醇停药。总之，34项国际团队提交了61种型号。这些团队中的七个提交了具有同样高的预测能力的模型，因此技术上“赢得了”挑战。最预测性的五种临床因素是血红蛋白，碱性磷酸酶，天冬氨酸氨基转移酶，前列腺特异性抗原和ECOG性能状况的测量。七个成功的模型全部将这五个因素整合到各种计算框架中。

有趣的是，在比赛正式结束后，这七个排名前的团队决定在比赛框架之外进行合作，从而形成了一个比单独提交的任何一个模型更具有预测性的组合模型。

"The seven groups from around the world—Finland, Germany, Canada, Israel and the U.S.—had never formally met before the challenge. It's a really exciting example of the power of scientific collaboration," says James Costello, PhD, senior author of the paper, investigator at the University of Colorado Cancer Center, assistant professor in the Department of Pharmacology at the CU School of Medicine, and director of Computational and Systems Biology Challenges within the Sage Bionetworks/DREAM organization.

组合模型分层耐心由于不良事件而在不良事件中停止多元植入的群体，高群体具有多于较低群体的低群的高群。

“这可能是这样的模型，可以帮助确定可能从不同的治疗中受益的患者，它也有可能立即影响未来的临床审判通过使用新型患者选择设计改善患者选择。在这样做时，可以减少临床试验所需的患者的数量，使得更有效地利用可用资源，“大学堪萨斯医疗中心的生物统计数据助理教授和第一作者之一，博士纸。

该挑战旨在促进和利用开放式问题与开放式数据相结合的潜力。

“该领域无疑正在朝着临床试验数据更加开放共享的模式发展。该项目是一个很好的例子，说明了如何从现有数据中获得新知识，以及如何使临床数据开放和自由获取可以最大限度地利用这些有价值的数据，使患者受益。”图尔库大学图尔库生物技术中心生物数学副教授，计算生物医学和生物信息学研究主任，Åbo Akademi大学芬兰。

该项目是16个机构的合作成果，由学术研究机构(包括CU癌症中心)、开放数据倡议(包括项目数据领域、Sage Bionetworks和DREAM Challenges)以及行业和研究合作伙伴(包括赛诺菲、阿斯利康和前列腺癌基金会)领导。

因为只有10%到20%的病人停止治疗不良事件,没有单一的审判已经足够的病人与统计显著性预测谁会停止多西他赛——通常,这些试验测试的有效性治疗人群中,能够完成方案并没有用来回答这个次要的问题将无法完成。如果临床试验结果仍然受到学术或行业赞助者的阻拦，那么第二个问题将仍然没有答案;然而，决定打开这些临床试验数据允许目前的研究人员结合从四个以前的试验的数字，汇集超过2000名患者-足以开始识别统计上的显著模式。

“项目数据领域的临床试验数量继续增长。在这项研究进行的时候，他们的数据库中有大约1万名患者。现在有超过70000个，这意味着我们将能够更准确地探索未来的问题，并提出由于数据访问受限而无法解决的问题，”Costello说。

该项目在研究派系之间的辩论中进行，其中一个人认为，研究应该产生旨在专门探索研究问题的新数据，以及在挖掘以前产生的新洞察数据中看到价值的另一个派系。虽然诸如“研究寄生虫”的对抗术语，但已被用于描述此类数据科学家，这项研究弥补了这些派系之间的差距，以发展必要的研究共生。帮助从临床试验中获益原始数据的临床医生与研究人员合作，开发新工具并从这些数据中汲取新的结论。

“最终，我们想做的是有一个更动态的互动临床试验设计。随着患者进来，我们可以使用这些统计模型来帮助匹配正确的审判的合适人选，“Costello说。

一是研究共生关系:国际、多机构的研究合作来挖掘以前产生的，开放数据现在提供了一个工具，可以更好地利用患者的临床特征，并简化过程临床试验。

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