SARS-CoV-2在中国武汉首次出现COVID-19病例前几个月未被发现传播:研究

新型冠状病毒在武汉武汉第一个Covid-19案件前发动未被发现的月份
SARS-COV-2病毒在显微镜下。信贷:国家过敏和传染病研究所

利用加州大学圣地亚哥医学院研究人员的分子约会工具和流行病学模拟,亚利桑那大学和Illumina,Inc。的同事估计了SARS-COV-2病毒可能在最多两个月内未被发现在2019年12月武汉武汉描述了第一次人类Covid-19之前。

写在3月18日,2021年在线问题科学他们还注意到他们的模拟表明突变超过四分之三的时间自然死亡而不会引起流行病。

加州大学圣地亚哥分校医学院传染病和全球公共卫生系副教授、资深作者乔尔·o·韦特海姆博士说:“我们的研究旨在回答SARS-CoV-2在被发现之前能在中国传播多久。”

“为了回答这个问题,我们组合了三个重要信息:详细了解在锁定之前的SARS-COV-2如何在武汉传播,中国病毒的遗传多样性以及最早的Covid-19案例的报告中国。通过结合这些不同的证据,我们能够在SARS-COV-2开始在湖北省迅速流通时,我们能够提高2019年10月中旬。“

Covid-19的案件首次于2019年12月在武汉举行,位于中国湖北省。病毒迅速蔓延到湖北之外。中国当局签到该地区,并在全国范围内实施缓解措施。到2020年4月,病毒的局部传播受到控制,但到那时,Covid-19具有超过100个国家的宣传报告案件。

SARS-COV-2是一个动物园,据信已经从未知的动物宿主跳到了人类。根据早期诊断的Covid-19患者的研究,已经开始识别病毒首先在人类中蔓延的众多努力。第一群病例和最早测序的SARS-COV-2基因组 - 与华南海鲜批发市场相关,但研究提交人表示,市场集群不太可能标志着大流行的开始,因为最早的Covid-19案件没有与市场的联系。

区域报纸报告建议Covid-19湖北诊断日期返回2019年11月17日,建议在中国当局颁布公共卫生措施时,病毒已经积极发动。

在新的研究中,研究人员使用了分子时钟进化分析,试图在第一个或指数发生时in in in sars-cov-2的情况。“分子时钟”是一种技术的术语,该技术使用基因的突变率在这种情况下发散的两种或更多种寿命时,当SARS-COV-2的所有变体的共同祖先存在时,在本研究中估计早在2019年11月中旬。

分子年代的最近共同祖先往往被认为是同义词索引病例的一种新出现的疾病。然而,合著者、亚利桑那大学生态学和进化生物学教授Michael Worobey博士说:“可以想象,索引病例发生在共同祖先之前——这次爆发的第一个病例可能发生在估计的共同祖先之前的几天、几周甚至几个月。”确定‘系统发育融合’的长度是我们研究的核心。”

基于这项工作,研究人员估计,在中国的SARS-COV-2感染的人数不到2019年11月4日的中位数,到2019年11月4日.1后,这是四个人,即2019年12月1日的四个人。武汉的第一次住院治疗,后来被确定为Covid-19发生在12月中旬。

研究作者使用了多种分析工具来模拟SARS-CoV-2病毒在最初爆发和大流行初期可能的行为,当时SARS-CoV-2病毒在很大程度上是一个未知的实体,公共卫生威胁的范围尚未完全认识到。

这些工具包括基于病毒已知生物学(如其传播性和其他因素)的流行模拟。在这些模拟中,只有29.7%的病毒能够创造自我维持的流行病。在另外的70.3%中,病毒在死亡前感染的人数相对较少。在首例病例出现8天后,平均失败的疫情就结束了。

“通常,科学家使用病毒遗传多样性来获得当病毒开始传播时的时间,”Wertheim说。“我们的研究通过建模在产生观察到的遗传多样性之前,通过建模病毒可能已经发动的时间来增加这种方法的重要层。

“我们的方法产生了一些令人惊讶的结果。我们看到,我们试图模拟的三分之二的流行病灭绝了。这意味着如果我们能够及时回到2019年,三次,三次中的两次,两次超出三次,Covid-19本身不会在没有点燃大流行的情况下出现。这一发现支持人类不断被动物群轰炸的概念。“

韦特海姆指出,即使2019年秋天SARS-CoV-2在中国传播,研究人员的模型表明,至少在那一年12月之前,它的传播水平都很低。

韦特海姆说:“鉴于此,很难将中国的低病毒水平与欧洲和美国同时声称的感染情况相协调。”“我对当时中国以外有关新冠肺炎的说法持怀疑态度。”

作者写道,原位的SARS-COV-2的原始菌株成为流行病,因为它被广泛分散,有利于坚持不懈,因为它在传输更容易的城市地区蓬勃发展。在涉及较密集的农村社区的模拟交换中,流行病将灭绝94.5%至99.6%的时间。

这种病毒自变异多次,多种变体变得更加传播。

“流行的监测没有为SARS-COV-2这样的病毒做好准备,”Wertheim说。“我们正在寻找下一个SARS或MERS,以高速杀死人的东西​​,但在后智,我们看到具有适度的死亡率的高度传播病毒也可以将世界置于低位。”


进一步探索

关注2019冠状病毒(COVID-19)疫情最新消息

更多信息:Jonathan Pekar等,湖北省SARS-CoV-2指示病例的时间,科学(2021)。DOI: 10.1126 / science.abf8003
期刊信息: 科学

引文:SARS-COV-2在武汉第一个Covid-19案件前分发未被发现的月份,中国:学习(2021年,3月19日)从HTTPS://medicalXpress.com/news/2021-03-sars-cov-循环 - 未被发现的月份 - Covid-.html
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