研究:DNA变异目录有助于发现疾病的根源

DNA
来源:国家卫生研究院

一个庞大的人类DNA目录正在帮助研究人员发现导致疾病的微小故障,部分原因是指出了一些错误的线索。

该数据库拥有超过6万人的基因密码,旨在进行研究这通常是由单个故障基因引起的。这些疾病中的大多数是如此罕见,以至于一般公众从未听说过它们,但有数千种这样的情况,作为一个群体,它们影响着大约1%的新生儿。

更准确的识别马萨诸塞州剑桥(Cambridge)布罗德研究所(Broad Institute)和波士顿(Massachusetts General Hospital)马萨诸塞州总医院(Massachusetts General Hospital)的丹尼尔·麦克阿瑟(Daniel MacArthur)说,“对患者来说,这是一种明显而直接的益处。”

他是该杂志周三发表的一篇分析文章的资深作者自然该数据库从20多项疾病研究中提取DNA数据。他表示,该网站于2014年上线,自那以来已被咨询超过500万次。

对于罕见的疾病,医生试图通过分析病人的DNA来寻找基因原因。但每个人的DNA编码都有成千上万的微小差异,而我们的目标是找出是哪一种或两种差异使人生病。

研究人员经常通过联想负罪感来做到这一点。如果一个患者出现了变异,但在其他患者中却从未见过或极其罕见,它可能被认为是疾病的原因。

挑战在于从公众那里获得足够的DNA。如果抽样太小或对不同的人群不够全面,一个变异可能被错误地指责为病人的问题的原因。一个更好的样本可能会显示,这种变异实际上在健康人群中出现得足够频繁,以至于它显然没有让任何人生病。

错误的线索会造成伤害麦克阿瑟说,有些患者甚至错过了治疗。

周三发表在《科学》杂志上的一项不相关的研究提出了这样一个“基因误诊”的例子新英格兰医学杂志。它关注的是一种叫做肥厚性心肌病的遗传性疾病,这种疾病会增厚还会干扰血液泵送。

研究人员检查了一家测试实验室三年的记录,发现7名患者被告知他们携带了与心脏病有关的两种DNA变体中的一种。两种变异后来都被重新归类为良性。

其中至少5名患者是非洲裔。哈佛大学的研究人员表示,如果这些变异的原始研究样本中包含了足够多的美国黑人,他们可能就不会得出错误的结论。

他们说,名为ExAC的新DNA目录可以很好地避免此类错误。它提供了一个比过去更全面的DNA变异的集合。上面列出的大约1000万个微小变异来自欧洲、非洲、南亚、东亚和拉丁裔。

在该杂志周三发布的另一项研究中医学遗传学英国的作者们利用ExAC的数据对最近的一些报告提出了质疑还有第二种心肌疾病

的分析自然提供了ExAC如何指出过去错误的另一个例子。研究人员研究了192种与疾病有关的DNA变异,但ExAC显示,这些变异在普通人群中非常常见,以至于这些关联看起来是虚假的。

研究人员发现,按照标准标准,至少163例应被重新归类为良性或可能良性。研究人员报告称,截至去年12月,有126个已被重新分类。麦克阿瑟说,这可能反映了ExAC数据库的影响

但他说,还需要比ExAC更大的数据库,才能明确地将基因变异与疾病联系起来,或将它们排除。“我们还有很长的路要走,”他说。

华盛顿大学西雅图分校(University of Washington in Seattle)的遗传学专家杰伊·肖endure没有参与这项新研究,他说,与以前的数据库相比,ExAC的目录具有优势。“毫无疑问”,它将加速和完善对疾病起因和病人护理的基因方面的研究,他在一份报告中写道自然评论。


进一步探索

揭示了人类基因变异的新见解

更多信息:引用:
DOI: 10.1038 / nature19057
DOI: 10.1038 / gim.2016.90
DOI: 10.1038 / ng.3638

©2016美联社。保留所有权利。

引用研究:DNA变异目录有助于发现疾病的根源(2016年8月17日),2021年4月27日从//www.puressens.com/news/2016-08-dna-variations-roots-disease.html检索
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