癌症研究人员开发新的软件解锁的祖先
知道你的祖先来自哪里可以更好的癌症治疗的关键?也许,但是,关键在哪里?我们如何跟踪癌症的远古祖先的现代解决方案?冷泉港实验室(3)研究教授亚历山大•Krasnitz答案可能取决于深处巨大的数据库和医院档案包含成千上万的肿瘤样本。
Krasnitz》冷泉港实验室和博士后帕斯卡Belleau正在努力揭示了系统之间的连接癌症和种族。他们已经开发了新软件,准确地推断出大陆祖先从肿瘤DNA和RNA。他们最新的研究发表在癌症研究,他们的工作可以帮助临床医生开发新的治疗早期癌症检测和个性化的策略。
“为什么不同人种和种族生病的人以不同的速率与不同类型的癌症吗?他们有不同的习惯,生活条件,exposures-all种类的社会环境因素。但可能会有遗传因素”Krasnitz说。
Krasnitz的团队训练他们的软件工具使用混合DNA样本。他们创造了这些概要文件从癌变和不相关的癌症基因组的一个已知的背景。然后测试软件的性能对胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌、和血液癌症患者标本已知的祖先。研究小组发现软件匹配他们的混合动力车大陆人口超过95%的准确率。
“我们有一个好的模型的基础上,“Krasnitz说。“但很少人来自一个祖先。在某种程度上我们都融合在一起了。现在我们正在努力看起来更深,血统不明的肿瘤样本测试,揭示祖先的混合物,实现更多的区域特异性。”How specific? For now, think West Africa as opposed to East Africa.
Krasnitz和Belleau最近加入了一个结直肠癌研究合作Northwell健康和纽约州立大学州南部医学中心。允许他们探索研究结肠直肠癌变异基因以不同的方式取决于特定种族或种族。他们希望进一步完善他们的软件来推断不仅整个基因组,每一个人的祖先序列。
“如果我们能够识别更多的本地化的血统,易受不同的癌症或其他积极的疾病,它可以帮助我们确定特定基因组的一部分责任和目标治疗,“Belleau说。
现在,一个简单的DNA拭子可以告诉你你从哪里来,你站继承的疾病。在未来,它也会给你打败他们的方法。
