酶与癌细胞系中大多数普遍的突变特征相关的酶

酶与癌细胞系中大多数普遍的突变特征相关的酶
使用人类癌细胞系研究APOBEC3相关诱变的起源。A,用于在特定时间表上体外跟踪突变采集的实验设计。示意图是使用生物器生成的。B,从5个库存细胞系和251个父母克隆的突变目录中鉴定出的SBSS提取的APOBEC相关特征(SIG。)的曲线。将突变曲线绘制为在胞嘧啶或胸腺嘧啶碱基上分类为96个可能的三核苷酸序列上下文中的全基因组取代(Y轴)的百分比(X轴;扩展数据图4A)。随后对宇宙特征的反卷积表明,SB288A对应于宇宙参考签名SBS2,SBS288B到SBS13(称为SBS13A),SB288E代表宇宙SBS13的新版本,该版本是SBS13B的SBS13B和量化的SBS13B(而不是量化的)(而不是量化的SBS13B)(而不是量化的)(而不是量化的)。。PCAWG,整个基因组的泛伴奏分析;WGS,全基因组测序。信用:自然(2022)。doi:10.1038/s41586-022-04972-y

一支隶属于美国和英国几个机构的研究人员团队发现了APOBEC3A酶与癌细胞系中最普遍的突变特征之间的联系。在他们的论文中发表在《杂志》上自然,该小组描述了从人类癌细胞系中去除APOBEC3突变,以了解有关可能的聚类特征的更多信息。

先前的研究表明,大多数癌症基因组具有可能与称为APOBEC3家族有关的突变特征。这项工作表明,这些酶在诱变中起作用。其他先前的工作表明,特定的酶Apobec3b是该家庭最有可能的成员突变。在这项新的工作中,研究人员仔细研究了另一个家庭成员 - apobec3a,并发现证据表明它实际上是最负责任激活突变的酶。

为了了解有关可能的APOBEC3特征的更多信息,研究人员从组成的细胞中删除了引起酶家族差异的突变,即apobec3a和apobec3b在多个人类细胞系样品中。他们总共与251合作取自膀胱,乳腺癌或淋巴瘤癌的患者。

然后,研究人员分析了样品,以识别缺失的签名。他们发现,Apobec3a的签名存在比Apobec3b更强,这表明酶更有可能导致促进癌性突变。他们还指出,他们的工作是第一个显示内源性apobec酶是癌细胞突变特征的主要驱动因素的证据。

研究人员指出,他们的工作并不排除APOBEC3B作为突变活性的贡献,因为在某些细胞线中,APOBEC3B的缺失实际上导致突变增加。这一发现表明,这两种酶可能在不同的细胞中起不同的作用。他们承认,需要更多的工作才能发现这种角色是互斥的还是酶共同起作用。研究人员得出的结论是,他们的作品在围绕APOBEC3酶家族扮演的角色的二十年中也支持了理论。


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更多信息:Mia Petljak等人,人类癌细胞中APOBEC3诱变的机制,自然(2022)。doi:10.1038/s41586-022-04972-y
期刊信息: 自然

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引用:与癌细胞系中最普遍的突变特征相关的酶(2022年7月29日),于2022年7月30日从//www.puressens.com/news/news/2022-07-enzyme-link-link--link--linked-prevalent-pravalent-mutational-mutational-signatures.html.html
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