研究揭示了驱动儿童治疗相关髓系肿瘤的突变

用化疗等方法治疗癌症的儿童可能发展成与治疗相关的髓系肿瘤(第二种癌症)，预后不佳。圣裘德儿童研究医院的科学家们已经鉴定出84种此类髓系肿瘤的基因组异常，这对早期干预以阻止这种疾病具有潜在意义。一篇详细介绍这项工作的论文今天发表在自然通讯．

体细胞(癌症)和种系(遗传)基因组的改变到目前为止，儿童髓系肿瘤的驱动治疗还没有得到全面的描述。研究人员使用了多种测序技术(全外显子组、全基因组和RNA)来表征84例与小儿治疗相关的髓系肿瘤的基因组谱。数据来自白血病患者，实体肿瘤或脑部肿瘤他们接受了不同类型的化疗后来都患上了髓系肿瘤。

“我们早就知道的一件事是，一旦孩子们发展出这种第二种能力肿瘤结果真的很差，”共同通讯作者杰弗瑞·Klco说，他是圣裘德病理学的医学博士。“导致这些肿瘤的变化在儿童中与在成人中不同，这强调了在儿科中专门研究这些肿瘤的必要性。”ob体育开户网址

合作产生新的理解

研究结果揭示了体细胞环境中的几个显著突变，包括Ras/MAPK通路的改变、RUNX1或TP53的改变以及KMT2A的重排。此外，结果显示一种名为MECOM的转录因子表达增加，这与MECOM由于遗传重排而异常接近增强子有关。

这项研究得益于计算工具旨在降低错误率，包括CleanDeepSeq和SequencErr。这些方法有助于区分真正的突变和测序错误。

有了这些工具，研究人员可以将突变追溯到与治疗相关的两年前骨髓当肿瘤发生时，早期干预可能对患者有益。

“这项工作表明，我们可以早期发现这种类型的恶性肿瘤，以研究预防性治疗是否能使患者受益，”圣裘德计算生物学的联合资深作者Xiaotu Ma博士说。

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