新冠病毒传入俄罗斯至少67次

病毒
信用:未提出/ CC0公共领域

HSE University和Skoltech的研究团队以及圣彼得堡Smorodintsev研究所的专家以及RAS Kharkevich信息传输问题(IITP),发现SARS-COV-2病毒至少独立进入俄罗斯67次,主要是在2月底和2020年3月初。绝大多数介绍来自欧洲国家。没有中国介绍的案件,这可能是由于及时关闭了与该国的边界。目前,九个地方病毒谱系在俄罗斯传播,这些俄罗斯并不呈现世界其他地方。鉴于俄罗斯积极地“从国外进口”病毒,研究人员尚未检测到任何在其他国家/地区出口的SARS-COV-2谱系。

文章,“俄罗斯SARS-COV-2爆发的早期阶段的基因组流行病学”发表在自然通信

研究人员使用211的分析和构建系统发育树,在Smorodintsev研究所测序,流感的流感测序。从3月11日至4月23日的俄罗斯地区(包括克里米亚共和国)的患者获得了所有基因组,从2020年3月11日至4月23日,所产生的数据集反映了俄罗斯疫情早期阶段的情况。

此外,为了建立系统发育联系的全部范围,学者使用了来自2020年5月26日的世界其他地区的19,623个SARS-COV-2基因组的数据集。分析还广泛地使用了俄罗斯边境的人民过境数据在这个国家。

研究人员建立的SARS-CoV-2模型表明,在sars流行的早期阶段,当时进化出来的几乎所有SARS-CoV-2谱系都在俄罗斯传播。与此同时,绝大多数基因组属于欧洲流行的谱系。结果发现,其中只有2%是亚洲血统,而他们占当时中国血统的50%左右。这意味着冠状病毒“进口”的主渠道是来自欧洲国家的客流。也许,中国血统也来自欧洲,因为与中国的边境在那之前就已经关闭了。

研究人员认为这么高的多样性由于在3月初的不同俄罗斯城市中的至少67个独立病毒介绍,由于至少67个独立的病毒介绍。其中有九九介绍导致了当地病毒谱系的出现,只能在俄罗斯传播。

“该研究表明了一种客观地研究人口中蔓延的病毒的路径和特征的方式。今天是研究人员的独特情况:我们正在获得数据,包括基因组数据,几乎实时。”谢谢“到大流行,我们更广泛地学习了很多关于流行病,这将有助于将来预测和控制它们,“统计和计算基因组学国际实验室负责人弗拉基米尔Shchur说

最有趣的结果之一是推出该流行病的病毒在俄罗斯出现了很晚。为俄罗斯带来了小说冠状病毒的大多数人抵达3月初。在该国没有特定谱系的早期演进痕迹。

SARS-COV-2来到俄罗斯留下来。没有“出口”俄罗斯国外病毒变化的迹象(至少对具有数据提供的国家)。这使该国除了作为意大利和西班牙等全球超级展示者,为欧洲流行病或英国奠定了基础。在俄罗斯里面,病毒进口后几乎立即蔓延。俄罗斯第一个发生在3月11日的俄罗斯传播。

研究人员特别关注了在圣彼得堡的一家非传染性医院——弗雷登医院(Vreden Hospital)爆发的病毒。在那里,700多人被隔离了一个月,其中400多人被感染。据该市州长亚历山大·贝格洛夫(Alexander Beglov)称,该病毒是由一名从土耳其度假回来的雇员带来的。然而,对该机构数十个基因组的分析表明,该病毒在那里被引入了2到3次。每一次,这都导致了一次特定的爆发,合并起来,看起来像一次大爆发。

Vreden医院案例的具体特征 - 它的孤立的社区 - 使其看起来像大流行开始的钻石公主游轮的臭名昭着的感染。这种封闭的人群真的被一个介绍所感染。没有理由认为圣彼得堡的情况不同。并且只有基因组分析有助于揭示医院感染的真正动态,多重重复病毒介绍。

基因组流行病学只是能够在2019年11月 - 2019年1月20日至1月20日在社交媒体上持续讨论了俄罗斯“早期流行病”的谣言和神话。它还展示了国家限制性政策的有效性。例如,及时关闭与中国的边界不允许在1月20日和2月20日在俄罗斯引入新的冠状病毒。

与此同时,2020年2月和3月,欧洲和其他国家控制旅客流量的措施被证明是不够的。这就是SARS-CoV-2的来源,它在当地引发了几次疫情,最终导致全面流行。

此外,基因组流行病学是流行病学家,医生和疫苗开发人员的良好实用工具。自大流行开始以来通过的时间越多,来自行星的所有部分的病毒的测序基因组越多。不同的谱系将进一步离开,这将有助于我们了解SARS-COV-2的一般进化载体,如何适应人类以及它是否展示了衰减的迹象(降低了对人体和毒力的有害影响)。


进一步探索

俄罗斯的Covid-19菌株没有来自中国

更多信息:安德烈B. Komassarov等。俄罗斯SARS-COV-2爆发的早期阶段的基因组流行病学,自然通信(2021)。DOI:10.1038 / s41467-020-20880-z
信息信息: 自然通信

由国家研究大学高等经济学提供
引文:新冠病毒传入俄罗斯至少67次(2021年1月28日),从//www.puressens.com/news/2021-01-coronavirus-russia.html检索2021年4月26日
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