2020年8月18日报告
跨数据源三角定位,了解COVID-19
对任何个人或组织的权力和渴望的一种考验,是掌握任何新的、足够先进的技术机会的能力,这些技术机会迫切地呈现在全世界面前。例如,当智能手机首次出现时,这类人不为自己创建基本的应用程序就不会休息。当强大的新CRISPR技术可用时,他们都没有休息,直到自己尝试了基因编辑技术。换句话说,对他们来说,礼物和诅咒就是,不知道事情是怎么做的,比被剥夺基本的物质享受更痛苦。
生物学问题与许多人为技术根本不同,因为解决方案不仅难以访问,它们往往甚至不存在。它们必须从头开始而不是抬头并复制。点的案例是当前的Covid-19流行病。与Covid-19相关的大量数据积累在过去几个月内。从此数据中获取可操作的知识现在已成为当天对所有人大而小的日子的首映挑战。
一家公司叫选择最近开发了一个软件平台其目标是综合世界上所有的生物医学知识。当疫情开始时,他们奋起迎接挑战,迅速发表了一篇又一篇揭露疾病关键方面的开创性论文。最近,我与联合创始人兼首席科学官Venky Soundararajan和科学研究总监AJ Venkatakrishnan就其中几篇新论文进行了交谈,包括他们在周一发表的最新一篇eLife。
本文探讨了COVID-19病理学的一个日益重要的方面:所谓的COVID-19相关凝血病(CAC)。高凝状态尤其是COVID-19最严重病例中出现的急性呼吸窘迫(ARDs)的一个主要问题。人们自然会提出这样一个问题:COVID-19的严重症状是否可能涉及弥散性血管内凝血病(DIC)这一众所周知的现象,并因此采用类似的治疗方法。在DIC中,正常维持凝血和纤溶之间的微妙平衡严重失调。
通常,在整个身体中由DIC形式引起的血凝块,主要在小血管内。然后,随着各种凝血因子被消耗和耗尽,开始发生出血。因此,这种情况通常称为消费凝结病。没有一个单个标记可靠地捕获DIC的情况。相反,通常随着时间的推移和一致的病史以及一致的病史,通常需要对实验室值的星座进行适当地评估病症。治疗方案随着时间的推移而相似地变得更加复杂,在每种情况下,精确地裁缝不同的自然和人工产生的因素的增加的调色板。
教命的作者eLife纸张研究了246名Covid-19患者,2,460名Covid-19阴性患者在194个测定中累积累积约700,000个实验室测试。他们发现在诊断时,Covid-19患者的血浆纤维蛋白原显着升高,但诊断后七天血液生成血症通常在七天内解决。在临床介绍时,Covid-19队列中的血小板计数较低,但随后在未来10天内增加至Covid-19阴性患者的水平。在Covid-19患者中也观察到部分更高的血栓形成时间(APTT),但D-二聚体的水平(在其中产生的纤维蛋白降解片段血块溶解)可比较。
然后,作者使用神经网络来评估观察到的凝血相关的实验室趋势是否与血栓形成的临床表现有关。该分析证实,在Covid-19中可以发育出血和血栓形成的DIC样凝血病,但是稀有的5例稀有的5例患者中的2,232名患者的正式诊断。因此,虽然血小板计数我们所面对的是一种不同类型的疾病。
另一个最近eLife论文,作者使用了他们的平台,在宿主组织上进行ace2的综合表达谱分析细胞类型,它们随后与Covid-19致病性和病毒透射相关。为此,他们扫描了1亿生物医学文件以产生来自单细胞RNA测序,散装RNA-SEQ和蛋白质组学的概念关联。它们将舌角蛋白细胞和嗅性上皮鉴定为新的ACE2表达细胞群和SARS-COV-2感染的重要潜在部位。这分子指纹他们建立了令人惊叹的是与最近的痛经和Anosmia的临床报告(分别扰乱了味道和嗅觉)。
在第三篇论文中eLife,静音,AJ和其他人报告说,SARS-COV-2已经进化了在任何先前测序的冠状病毒中未发现的独特S1 / S2切割遗址,这导致在人上皮钠上发现的相同Furin可切割肽的醒目模拟物频道称为ENAC-α。作者表明,Covid进入全球大流行病的演变可能是由该ENAC-αChannel的目标模拟的部分驱动的。在人类中,通道对气道表面液体的稳态至关重要,其误操作与呼吸状况有关。
这些不同的论文在一起对我们对Covid-19的理解构成了大量的新贡献,并使用Newerence软件平台形成了未来研究的坚实基础。
AJ Venkatakrishnan等。1亿份生物医学文献的知识合成增强了冠状病毒受体的深度表达谱,eLife(2020)。DOI:10.7554 / Elife.58040
匍匐Anand等人。SARS-COV-2战略性地模仿人体enac的蛋白水解激活,eLife(2020)。DOI:10.7554 / ELIFE.58603
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