将精准肿瘤学付诸实践

拉什大学医疗中心是第一个推出医疗记录公司Epic的基因组结果模块的医疗保健组织，为提供者提供了在分子水平上定制患者护理所需的工具。Rush将使用该模块作为其精准肿瘤中心的一部分，将基因组测序数据的力量整合到肿瘤学家的日常工作流程中，以便他们为患者提供最好的护理。

“为了真正实现精准肿瘤学的承诺，供应商需要访问、解释和应用这一点基因信息地点和时间临床决策拉什大学癌症中心的谢巴基金会主任、生物医学信息学的全国领导者米娅·利维博士说。“这项新技术使即时洞察和干预成为可能。”

该模块解锁关键数据，并无缝地将基因组测试的结构化结果编织到工作流程癌症护理团队。当拉什的医生认为某个患者将从基因组检测中受益时，他会将肿瘤和/或血液样本发送给拉什的基因组检测合作伙伴Tempus。

Tempus的广泛基因组测试可识别患者可操作的基因组变异，并提供与患者分子和临床特征相关的治疗方案(包括匹配的临床试验)。Tempus的报告直接流入Epic，允许临床医生根据每个患者的情况做出数据驱动的决策。将基因组数据集成到电子健康记录中，为临床医生提供了患者基因组和其他临床信息的单一视图。

Tempus首席运营官Ryan Fukushima说:“到目前为止，据我们所知，还没有其他外部实验室能够将下一代测序基因组检测作为结构化变体结果直接无缝集成到电子病历中，我们很高兴能够通过Rush将这一新功能推向市场和供应商。”Epic的新模块允许临床医生只需点击按钮就可以订购Tempus测试，并将这些测试结果合并到患者的记录中，为护理团队提供实时做出治疗决策所需的所有数据。”

将基因组数据与病人的其他故事联系起来

“癌症是一种基因组疾病，”利维说。“但我们DNA中允许一些细胞变成癌细胞的微小变化也为我们如何治疗和预防癌症提供了线索。将基因组数据与患者的其他故事联系起来，可以提供更完整的画面。”

Levy指出，虽然检测和分析一个人基因组(dna中发现的一整套遗传指令)变化的能力在过去几年中呈指数级增长，但将这些信息转化为具体和实用的治疗方法的能力受到电子病历结构上的限制，这些数据无法成为临床工作流程的一部分。因此，在2018年，Rush肿瘤学家和技术专家开始与Epic开发人员合作设计基因组学模块。

“在开发新功能时，我们关注的是它们如何适应临床医生的整体工作流程，并最终提供可操作的信息来改进病人护理Epic公司负责基因组模块的软件开发人员凯瑟琳·普罗瑙(Catherine Procknow)说。“利维博士作为我们基因组学智囊团的一员，与我们密切合作，就如何设计对临床医生最有用、对患者有益的模块提供指导。”

该模块提供了一个专门的数据结构，使提供者(甚至那些没有基因组学背景的人)能够将基因组学信息集成到他们的临床决策过程中。它将基因检测、基因小组和完整测序的原始数据转化为可操作的基因组指标，存储在患者的病历中。

研究人员将能够将去识别的、结构化的基因组数据整合到他们的努力中，以发现预测癌症风险、预后和治疗反应的新方法。将基因组数据与病史和其他临床数据进行比较的能力将加快发现的步伐。

拉什大学健康系统首席执行官Ranga Krishnan博士说:“癌症护理已经到了一个关键时刻，基因组医学的惊人前景实际上是日常医学实践的一部分。”“我们早就知道，癌细胞含有医生根据患者DNA精确设计的治疗方法所需的线索，但很少有提供者具有解码这些信息的专业知识。将基因组检测结果整合到电子医疗记录中——做出护理点决策的地方——使得癌症基因组学的力量成为拉什常规癌症护理的一部分。