DNA中突变“热点”的研究可能导致对癌症风险的新见解
印第安纳大学的新研究已经确定了“热点”在DNA中的遗传突变风险明显升高。
出现这些突变,因为在细胞分裂期间可以在DNA复制时发生“拼写错误”。最近的分析,发现DNA中的随机错误在许多癌症类型中发挥着大作用,强调需要更多地了解更多关于触发这些错误的东西。
IU-LED研究,进行大肠杆菌,出现在八月期刊的“亮点”部分中的两篇论文中遗传学。所识别的“热点”是特定的大肠杆菌和相关细菌,但工作可以提供识别人DNA中类似麻烦斑点的路线图。
“这项研究让我们更接近了解细胞的复制机械如何与DNA互动,”帕特里西亚福斯特州艾格丽塔教授,艺术与科学系的艺术科学教授。“如果您可以确切地理解为什么在细菌中DNA上的特定点发生错误,它会让您更接近了解一般原则。”
福斯特是两篇论文之一的第一作者。另一本文的第一作者是Brittany Niccum,博士学位。在研究时福斯特实验室的学生。
来自DNA复制误差的癌症的风险在某些组织中最高,如前列腺和骨骼 - 那里的蜂窝更新率较高意味着由于DNA被复制而产生的错误可能发生错误。
“存在含有”癌症司机“的基因组的部分,其中DNA的变化可以使肿瘤细胞增殖,”福斯特说。“如果你能知道DNA的部分有更高的突变风险,你可能能够将你的分析专注于这些”热点“来预测接下来会发生什么。”
在大肠杆菌研究人员发现,DNA复制误差的可能性在DNA序列中的可能性高达18倍,其中序列中的相同化学“字母”连续多次重复。他们还发现,具有三个字母的特定模式的DNA序列中的可能性高达12倍。
DNA序列中的这些字母模式先前已被识别为复制误差的公共位置。但培养了新研究中的数据纯粹体积 - 在250,000代中累积的30,000个突变的整个基因组的分析 - 提供了以前所未有的准确度确定错误率所需的“统计重量”。
研究还强调了两种系统在DNA复制中的重要性:“校对剂”酶和称为不匹配修复的分子途径。两者都作为防御酶被称为DNA聚合酶的错误 - 以每秒1,000个字母的惊人速率复制基因组。
检测到错误后,此校对函数重置复印过程。IU研究人员发现,“切换”此功能引起了4,000倍的错误。正在关掉不匹配修复,校样器的备份系统导致错误200倍。
“当我们关闭这些备份系统时,我们开始看到”纯粹的“错误 - 聚合酶更有可能在没有其他过程中造成错误的地方,”福斯特说。“到目前为止,我不认为任何人都可以真正看到DNA中这些错误热点的严重性。”
进一步探索
布列塔尼A. Niccum等人。在整个Coli的整个基因组中,在没有误差校正的情况下,复制误差的频谱测定,遗传学(2018)。DOI:10.1534 / Genetics.117.300515
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