离个性化抗生素治疗又近了一步

肠道中的微生物可以“抗拒”抗生素，导致抗生素抗性和可治愈的感染。一种新方法使得可以快速检测抗性基因，因此可以选择最有效的抗生素处理类型。

服用抗生素来对抗感染不一定解决你的问题。通常，肠道中的天然存在的细菌含几种抗性基因。这意味着肠道细菌可以与传染性细菌交换基因，导致抗生素耐药性。因此，了解电阻体-即。肠道微生物中存在的抗性基因可以极大地改善治疗。

现在，来自丹麦技术大学诺和诺德基金会生物可持续性中心(dtu biosustainability)的研究人员开发了一种超快速、廉价的方法，名为poreFUME，可以揭示肠道中的抗性基因池。

“通过这种方法，您将在1-2天内概述电阻，因此，能够迅速启动感染和比以前更好的结果，”Eric Van der Helm，Postdoc说丹麦技术大学生物科卫生博士生物核科基省诺德涅德斯基础中心。

该研究最近发表于期刊核酸研究。

抗生素耐药性每年造成70万人死亡

与当前方法相比，使用纳米孔测序的凹陷方法非常快，因为它不需要粪便细菌的生长，这需要时间并且可能是困难的。此外，来自设备的数据实时流式传输，因此用户不需要等到“运行”结束以访问关于实验的信息。

今天，从病人那里获得耐药性数据需要几周的时间。与此同时，这种抵抗特性可能会发生戏剧性的变化，患者将遭受健康状况的恶化。

每年70万人死于抗性感染，特别是住院患者;问题似乎在增长。对于许多患者来说，快速评估他们的个人池抗性基因在他们的粪便中可以是救命。

“我们的研究表明，这种方法为其他测序方法提供了一个很有前途的替代方案，它可以用于快速测定肠道等微生物群落的抗性。”我们非常确信，快速的抗性分析可以导致个性化抗生素治疗来自DTU Biosustain的教授和合著者Morten Sommer说。

便宜的跑步会带来不同

该研究是作为DTU和联合作者与Utrecht大学的威廉·瓦希克斯博士之间的合作进行的。重症监护室病人(ICU)。

本研究对来自ICU患者的5份粪便样本进行评估。在接受肺移植手术后，由于慢性阻塞性肺病(COPD)，患者接受了四种不同的抗生素治疗，以预防和对抗感染。样本在入院时、住院期间和住院后几个月收集。

结果表明，与标准化的电阻分析方法相比，凹陷方法精确为97％。测量电阻时，该百分比足够。

此外，poreFUME方法比目前的方法便宜得多，主要是由于所谓的MinION的低成本;这是一种小型的手持dna测序设备，科学家们可以从1000美元开始使用。相比之下，传统的所谓的下一代测序设备的价格在5万美元到1000万美元之间。

“如果医院可以购买比今天更便宜的耐压设备，它开辟了更多患者的更好分析，并希望较少的细菌性抵抗案例，”来自DTU BioSustain的联合作者和研究员Lejla Imamovic说。

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