前列腺癌基因组的全面视图收益率深刻的见解
第一次研究人员暴露的全部基因蓝图多个前列腺肿瘤,发现改变之前从来没有被发现并提供深度的遗传基础疾病的失误。研究中,通过关键的进步全基因组测序和分析,指出了几个新的前列腺癌基因和基因组变化的一个关键范畴作为前列腺癌增长的重要驱动程序。这项工作是由威尔康奈尔医学院的研究人员广泛的研究所和丹娜-法伯癌症研究所发表在2月10日出版的《华尔街日报》自然。
不像其他测序方法,目标基因组的特定部分,全基因组测序DNA使研究人员能够看在整个景观的肿瘤,从而能够洞悉全球变化和模式。资深作者Drs。李维Garraway和马克·鲁宾和他们的同事们使用这种策略来查看七的完整基因组前列腺肿瘤和比较正常组织样本发现异常区域。
“全基因组测序为我们提供了有趣的新见解类别的变化可能是特别重要的前列腺癌Garraway博士说,“Broad研究所的高级会员和医疗肿瘤学家和达纳法伯和哈佛医学院的助理教授。
前列腺癌是第二个最致命的癌症在美国男人,负责超过30000人死亡,每年超过200000新病例。前列腺癌研究的一个主要目标是识别潜在的药物靶点以及在肿瘤遗传特征可以区分懒惰和积极形式的疾病,并最终提高诊断和治疗。
鲁宾博士荷马t·赫斯特的肿瘤病理学教授和副主席在威尔康奈尔医学院实验病理学,性质比较研究不仅对基因组中拼写错误,而且对整个段落或部分基因组已经重新排列的文本。”一个惊喜是,前列腺癌没有大量的拼写错误,而是有一个大的,大量的重组,”鲁宾博士说,他也是一个病理学家在纽约长老会医院/威尔•康奈尔医疗中心。“我们从来没有猜到之前有很多这种类型的基因改变,因为我们没有合适的工具来寻找他们。”
这些变化被称为基因组重组——一种洗牌时从一个部分的一段DNA基因组脱落和再植本身在另一个位置。这些重组可以创造新的基因(称为“融合基因”),使基因操作不加以控制,甚至防止基因在所有工作。这种变化可以设置一个通向癌症细胞。通过寻找前列腺癌基因受到这些重组的影响在多个样本,研究人员发现新基因与疾病和发现新的机制可能推动癌症作为一个整体。Ashutosh博士提供的前列腺癌样本特瓦芮,泌尿道的肿瘤学教授罗纳德·p·林奇和泌尿学和公共卫生教授威尔康奈尔医学院和机器人泌尿道的外科医生和主任LeFrak纽约长老会医院/威尔康奈尔机器人手术中心。
“第一个全基因组视图显示我们诱人的证据,一些新的前列腺癌基因可能仍未被发现的我们没有采取一个全基因组的方法,“Garraway博士说。
几个肿瘤含有重组干扰CADM2蛋白的编码基因,蛋白质家族的一部分,防止肿瘤形成(称为“肿瘤抑制”)。三个样品还包含突变包括热休克蛋白家族成员,分子起着重要的保护作用,防止蛋白质失去适当的形状。抗癌药物,抑制这些蛋白质目前在临床试验中,但是目前尚不清楚是否前列腺癌会容易受到这类药物。
其他的基因重组涉及基因PTEN和MAGI2。PTEN是一个著名的肿瘤抑制基因和MAGI2似乎是其配偶;一个或两个基因的突变可能对之路设置细胞癌变。药物抑制这些基因通路影响也正在开发,提高的可能性,可以应用于前列腺癌的药物。
除了发现新的和怀疑基因,全基因组测序也给Drs。Garraway,鲁宾和他们的同事们深入了解基因组重组出现在第一位。目录的重组,研究人员寻找优惠和回贴往往发生和发现这些事件并不是随机分布在整个基因组。相反,在一些肿瘤这些事件往往发生在区域的基因组不活跃或沉默,而在其他肿瘤发生高度活跃的地区。该模式表明,错误由细胞虽然打开和关闭基因可能引起DNA重组,因此发挥的作用在癌症的发展。
研究者的研究结果也可能提供一个发展的关键起点新的前列腺癌的诊断工具。当病人被诊断为前列腺癌,目前几乎是不可能医生确定疾病的迅速推进,因此需要积极治疗,肿瘤是否仍将缓慢增长,迫使持观望态度。“这项研究开发新的可以增强我们的能力,诊断为前列腺癌标记,”鲁宾博士说。“我们也可以想象最终开发更多个性化的复发性肿瘤患者的诊断工具,基本上遵循肿瘤的进展测试新的基因组改变。”
虽然研究者的结果需要进一步研究和扩展到大量的肿瘤样本,初步分析开辟了许多新途径的调查,强调应用整体的力量基因组测序癌症。
“很多这些特性是无形的,”Garraway博士说。“现在,我们意识到在前列腺癌基因组测序整个,还有很多。这些发现是教我们很多关于前列腺癌生物学,我们只是没有欣赏。”
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