世界上第一个开放获取仪表板从基于废水的流行病学中揭示了COVID-19的社区水平趋势

世界上第一个开放存取仪表盘显示了亚利桑那州坦佩市。基于废水的流行病学的社区水平COVID-19趋势
由坦佩市人员进行实地采样。资料来源:亚利桑那州立大学Devin Bowes博士

由于阿片类药物危机和全球SARS-CoV-2大流行等公共卫生问题,创新城市已转向新技术,以更好地了解其社区面临的风险。

其中一项技术是基于废水的流行病学(WBE),这是一个新兴领域,可以跟踪下水道中的化学物质和病毒类型,作为全市公共卫生和安全政策和干预措施的公共数据工具。

这是亚利桑那州坦佩市之间独特的合作关系。亚利桑那州立大学首次使用这项技术进行跟踪并在世界上第一个开放获取仪表板上显示结果,为公众、消防部门和急救人员提供可操作的数据,为干预措施的实施提供信息。

后勤和基础设施坦佩市和亚利桑那州立大学已经实施了废水监测,能够在2020年4月大流行开始时迅速转向检测废水中的SARS-CoV-2。

在坦佩,废水数据与其他数据结合使用,如县和州关于疫苗和试验结果的数据、可获得性,以及更多。

“废水科学是我们城市的宝贵工具。这些数据帮助我们决定在哪里建立诊所,加强并调整应急行动,”坦佩战略管理和创新办公室临时主任Wydale Holmes说。“我们与亚利桑那州立大学的合作伙伴以及我们社区的信任使这一创新成为可能。

现在,第一次大流行浪潮(2020年4月至2021年3月)的完整数据结果已经出炉。这些数据展示了废水诊断作为SARS-CoV-2等健康威胁对社区的早期预警信号的力量。

世界上第一个开放存取仪表盘显示了亚利桑那州坦佩市。基于废水的流行病学的社区水平COVID-19趋势
自动采样器从人孔中回收收集的24小时复合废水样品。资料来源:亚利桑那州立大学Devin Bowes博士

研究表明,在某些地区,WBE可以在临床检测结果前6天至11天可靠地预测城市邮政编码和子邮政编码社区的SARS-CoV-2水平,同时还可以提前16天向地区医院和卫生保健中心提供即将到来的疫情预警。

亚利桑那州立大学教授Rolf Halden说:“数据表明,废水监测提供了超过两周的早期预警能力,从而有助于自信地预测我们城市和校园社区未来的临床病例量、发病率和死亡率。”

“一旦对个人进行随机临床测试,废水监测的早期预警能力就会下降,但正如我们的团队今年早些时候证明的那样,使用传统医疗工具筛查个人的价格比WBE高出60倍。”

“因此,这项最新研究研究了大流行期间收集的所有数据,再次强调了废水监测的力量,它是一种灵活、实用、非常经济的健康监测工具,其益处适用于经济手段较低的弱势人群。”

每周采集3天样本。在大坦佩地区的11个采样点共收集了1556个废水样本。大多数地区在2020年6月和2020年12月至2021年1月出现了两波病毒水平峰值。WBE显示,每升废水中SARS-CoV-2基因拷贝的最大浓度为3760万个。这一测量结果是在大流行高峰期发生在坦佩的一家医院,该医院在2021年1月11日采集时有一个活跃的COVID-19病房。

此外,下水道中SARS-CoV-2的检出量也与临床检测阳性病例数相关。WBE有潜力补充和丰富临床数据和人口信息,不仅从一个城市,而且到邮政编码和社区级别。

最后,在2020年5月至6月初的初步封锁期间,废水信息数据仪表板显示,从2020年5月11日至2020年6月8日这一周,瓜达卢佩镇的病毒浓度显著升高。从2020年6月开始,在强制佩戴口罩和在市政厅进行社区教育等迅速干预后,这一数字有所下降。

世界上第一个开放存取仪表盘显示了亚利桑那州坦佩市。基于废水的流行病学的社区水平COVID-19趋势
德文·鲍斯博士在亚利桑那州立大学环境卫生工程生物设计中心实验室为SARS-CoV-2分析准备样本。来源:Devin Bowes博士,亚利桑那州立大学

成功部署了WBE坦佩市和亚利桑那州立大学为继续使用WBE做好了独特的准备,以便尽早发现和识别下一个公共卫生威胁,以免它有机会压倒卫生保健能力。

Erin Driver博士说:“通过与坦佩市合作,我们的团队能够展示WBE作为一种平台技术,可以迅速适用于监测公共卫生问题的化学指标,如阿片类药物滥用,并跟踪传染性疾病威胁,如SARS-CoV-2。”Erin Driver博士与Devin Bowes博士一起领导市政-学术合作团队的数据收集和分析工作。

“WBE的最大好处之一是,在尚未采取实质性卫生保健应对措施的情况下,以及在临床检测地点和设备缺乏、疫苗接种运动推迟、检测疲劳出现或广泛使用家用快速检测掩盖了受影响社区的真实高感染水平的情况下,可以及早发现疾病暴发。”哈尔登总结道,并补充说:“WBE还有望解决与环境有毒物质接触有关的肥胖、糖尿病和癌症等其他公共卫生挑战。”

阿斯利康州坦佩市SARS-CoV-2废水监测仪表板和COVID-19社区卫生网站可在线获得。

“我们能做的还有很多科学。坦佩是一个创新的社区,亚利桑那州立大学是美国最具创新精神的大学。我们正在一起为世界各地的社区如何从这项科学中受益创造蓝图,”霍姆斯说。

这项研究发表在柳叶刀微生物

更多信息:Devin A Bowes等人,利用已建立的社区级开放废水监测网络来解决公共卫生优先事项:一项基于人群的研究,柳叶刀微生物(2022)。DOI: 10.1016 / s2666 - 5247 (22) 00289 - 0

指示板:covid19.tempe.gov /

引用:世界上第一个开放获取仪表板揭示了基于废水的流行病学(2022,12月7日)的COVID-19社区水平趋势,检索自2022年12月11日//www.puressens.com/news/2022-12-world-access-dashboard-reveals-neighborhood-level.html
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