科学家使用疟疾专业知识来跟踪Covid-19变体

科学家一直在使用遗传学来追踪疾病数十年。现在，普渡大学的一个团队，通常跟踪南部和中非的疟疾传播正在使用其专业知识来跟踪印第安纳州的Covid-19。

Giovanna Carpi的实验室研究传染病的基因组学，以更好地了解它们的传播方式。一位生物科学助理教授，她主要关注她的研究疟疾。随着大流行病的开始，她的实验室枢转了研究SARS-COV-2，小说的基因组流行病学新冠病毒这导致Covid-19，包括跟踪变体。

跟踪疾病的变种 - 无论它们是细菌，如结核病等细菌，疟疾等疟疾等病毒 - 有助于科学家了解他们在社区中的旅行方式，如何变异和适应，以及疫苗和其他缓解策略如何工作。

“我们研究了基因组流行病学，传染病的大规模基因组研究，我们的实验室正在投资新的测序和信息技术，以研究传染病的基因组，以了解传播，”Carpi说。“这使我们能够实时进行排序，进行基因组监测，这改变了我们对疾病传播的理解。”

Carpi和她的实验室是纯炎症，免疫学和传染病研究所的一部分，其跨学科致力于促进传染病，癌症和慢性炎症条件的治疗和理解。Carpi研究疾病的方式传播以及病原体如何发展，因为它们适应内在内部，并在感染者中移动。

目前，她的工作侧重于疟疾，特别是在赞比亚这样的国家，正在努力消除疟疾。在疟疾病例罕见的情况下，了解如何通过人口引入并持续到持续的持续传输是更重要的。重要的工作尚未被搁置，但自1月以来，新的冠状病毒已成为她实验室的另一个优先事项。

SARS-COV-2和疟疾彼此相同。疟疾是一种原生动物，由某些物种蚊子携带和传播的寄生虫。SARS-COV-2是一种病毒，主要通过人与人的接触和空气中的小液滴传播。但是，虽然它们是不同的疾病，但在微观水平和它们如何传播中，科学家用来研究它们是相似的。

“他们是非常不同的系统，但你使用相同的技术来研究它们，”卡佩说。“测序程序和计算非常相似。”

事实上，新的冠状病毒可能比疟疾更容易学习，因为它的基因组要小得多，更简单，更容易监测。Carpi在疟疾的工作以及她实验室的设备和专业知识，将她置于纯粹的位置，以及Purdue的动物疾病诊断实验室，能够跟踪Covid-19变体。

“我们为疟疾一直做这种跟踪，”卡佩说。“我们迅速转换，能够在2020年12月对SARS-COV-2进行调查，因为关注的变体被引入并开始在美国蔓延。我们必须扩大扩展。我们是印第安纳州唯一的实验室 - 与我们一起在动物疾病诊断实验室的合作伙伴 - 能够在一夜之间切换以研究SARS-COV-2基因组。我有一个惊人的实验室团队，我们已经能够适应非常快速的周转时间。“

跟踪病毒的遗传学，或任何疾病，让科学家介绍它如何通过社区迁移。患有类似变体的患者 - 具有类似突变的病毒 - 可能从同一个地方或彼此中获得病毒。新的变体可以指示从其他地方进入社区的新病毒。比较基因组学也可以帮助科学家了解变体如何应对疫苗接种，以及其他抗传染性措施，包括面具，检疫，社会疏散，密集清洁和其他程序。