监测系统跟踪医院的冠状病毒感染热点

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Credit:Pixabay / CC0 Public Domain

曼彻斯特大学队采用了新技术来检测和跟踪Covid-19在医院的传输。

概念系统的证明结合了运动和相互作用和患者的基因组测序,帮助路标如何最好地改善患者途径,员工运动,降低风险。

他们确定了医院内的热点,其中患者和员工可能接触并共享病毒SARS-COV-2的类似或相同的变种,这会导致Covid-19。

这些数据收集于2020年3月至6月之间,是曼彻斯特的科学家、临床工作人员和其结果在期刊上发表的结果el

这项研究在英格兰西北部的五家医院进行,可能会产生重要的影响控制。该团队将基因组测序应用于从173名医护人员和患者身上获得的咽喉和鼻腔拭子。

病毒就像所有的生物体一样,会随着时间的推移积累微小的基因变化,这些变化通常是完全中性的,不会给病毒带来任何额外的优势。

曼彻斯特队利用了病毒的自然遗传变化,了解不同员工和受病毒影响的患者的密切相关的样本。

如果一个受感染个体的COVID-19基因组看起来与另一个几乎相同,这表明他们共享一个共同的、附近的感染源。

将这些信息与患者和工作人员流动的数据相结合,可以确定在何时何地发生聚集性感染。

虽然使用基因组测序在可能需要至少一周的过程中识别Covid-19变体,但该团队相信该过程现在可以快速执行48小时。因此,该方法处于速度缩放的位置。

曼彻斯特大学的杰米·埃灵福德博士说:“这项研究中使用的方法完全描述了每个样本中病毒的特征,超出了常规检测策略。”

“这可以识别出现疫情的医院区域,并帮助警报感染控制团队。”

该方法的一个潜在限制是,在任何给定的时间点,两个个体可能偶然共享相似的变体,而不是相互感染的结果。

为了克服,该团队在急诊部门和30多个医院网站中排序病毒。

在类似的时间点收集来自这个更广泛的组的数据,他们可以识别分享病毒的人群的群集比偶然的预期更多的遗传。

Ellingford博士说:“如果我们要减少和预防医院的SARS-COV-2传输,则了解感染控制方法的有效性非常重要。

“虽然疫苗可能会降低医院人员的风险,但仍然存在感染的风险,并且强烈需要感染控制,以确保患者和员工安全。

“我们认为感染控制护理中的重要工具是测序,它提供了追踪和识别医院获得的传输的根本原因的现实可能性。

“它能够提醒我们在给定期间接触的个人,并份数相似的病毒样品。

“这可能导致有针对性的干预措施,最终阻止避免伤害在医院收购Covid-19的弱势群体。”

Graeme Black是曼彻斯特大学遗传学和眼科教授。

他说:“一旦医院确定了群集,他们就可以采取一系列措施使其安全。

“通过此信息,医院管理人员可以例如评估现有练习和轻松检查哪些是最有效的。PPE的使用也可以根据集群的位置进行调整。

“但我们还建议这些数据支持筛选策略的筛选策略,他们可能是SARS-COV-2的假设或无症状的患者是SARS-COV-2爆发的重要贡献者。

“我们还认为,开发出更精确地跟踪运动的方法,可以在医院里扩大个体之间接触的特征,并理解这项研究中实施的假设的准确性。”


进一步探索

基因组学研究确定了护理房屋中冠状病毒的传播途径

更多信息:Jamie M Ellingford等人。SARS-CoV-2院内传播的基因组学和医疗动力学,el(2021)。DOI: 10.7554 / eLife.65453
信息信息: el

由...提供曼彻斯特大学
引用:监测系统跟踪医院的冠状病毒感染热点(2021年3月30日),2021年4月21日从//www.puressens.com/news/2021-03-surveillance-tracks-covid-infection-hotspots.html检索
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