监测系统跟踪医院的冠状病毒感染热点
曼彻斯特大学队采用了新技术来检测和跟踪Covid-19在医院的传输。
概念系统的证明结合了运动和相互作用职员和患者的基因组测序病毒,帮助路标如何最好地改善患者途径,员工运动,降低风险。
他们确定了医院内的热点,其中患者和员工可能接触并共享病毒SARS-COV-2的类似或相同的变种,这会导致Covid-19。
这些数据收集于2020年3月至6月之间,是曼彻斯特的科学家、临床工作人员和医院其结果在期刊上发表的结果el。
这项研究在英格兰西北部的五家医院进行,可能会产生重要的影响感染控制。该团队将基因组测序应用于从173名医护人员和患者身上获得的咽喉和鼻腔拭子。
病毒就像所有的生物体一样,会随着时间的推移积累微小的基因变化,这些变化通常是完全中性的,不会给病毒带来任何额外的优势。
曼彻斯特队利用了病毒的自然遗传变化,了解不同员工和受病毒影响的患者的密切相关的样本。
如果一个受感染个体的COVID-19基因组看起来与另一个几乎相同,这表明他们共享一个共同的、附近的感染源。
将这些信息与患者和工作人员流动的数据相结合,可以确定在何时何地发生聚集性感染。
虽然使用基因组测序在可能需要至少一周的过程中识别Covid-19变体,但该团队相信该过程现在可以快速执行48小时。因此,该方法处于速度缩放的位置。
曼彻斯特大学的杰米·埃灵福德博士说:“这项研究中使用的方法完全描述了每个样本中病毒的特征,超出了常规检测策略。”
“这可以识别出现疫情的医院区域,并帮助警报感染控制团队。”
该方法的一个潜在限制是,在任何给定的时间点,两个个体可能偶然共享相似的变体,而不是相互感染的结果。
为了克服,该团队在急诊部门和30多个医院网站中排序病毒。
在类似的时间点收集来自这个更广泛的组的数据,他们可以识别分享病毒的人群的群集比偶然的预期更多的遗传。
Ellingford博士说:“如果我们要减少和预防医院的SARS-COV-2传输,则了解感染控制方法的有效性非常重要。
“虽然疫苗可能会降低医院人员的风险,但仍然存在感染的风险,并且强烈需要感染控制,以确保患者和员工安全。
“我们认为感染控制护理中的重要工具是病毒基因组测序,它提供了追踪和识别医院获得的传输的根本原因的现实可能性。
“它能够提醒我们在给定期间接触的个人,并份数相似的病毒样品。
“这可能导致有针对性的干预措施,最终阻止避免伤害在医院收购Covid-19的弱势群体。”
Graeme Black是曼彻斯特大学遗传学和眼科教授。
他说:“一旦医院确定了群集,他们就可以采取一系列措施使其安全。
“通过此信息,医院管理人员可以例如评估现有感染控制练习和轻松检查哪些是最有效的。PPE的使用也可以根据集群的位置进行调整。
“但我们还建议这些数据支持筛选策略的筛选策略,他们可能是SARS-COV-2的假设或无症状的患者是SARS-COV-2爆发的重要贡献者。
“我们还认为,开发出更精确地跟踪运动的方法,可以在医院里扩大个体之间接触的特征,并理解这项研究中实施的假设的准确性。”
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