癌症控制:非dna改变诱导肝细胞癌的代谢变化

癌细胞比正常细胞在无数方面获得生长优势。细胞编程的改变允许这些细胞以不受控制的方式生长，从而形成癌症肿块。肝细胞癌(HCC)具有高度恶性和侵袭性，具有高复发率和耐药表型，是最可怕的癌症之一。了解潜在的分子机制对设计治疗干预措施和预测患者预后至关重要。

癌症细胞使用代谢、免疫或生长相关的策略，这些策略可以通过细胞过程中的一些改变来控制。其中，“转录后RNA修饰”最近引起了人们的兴趣癌症生物学家。n6 -甲基腺甘氨酸(m6A)甲基化是一种RNA修饰，仍然是真核细胞中最丰富的表观遗传(非dna相关)修饰。处理m6A调控的蛋白质的异常活性与包括肝癌在内的几种癌症的侵袭、转移和耐药性等癌症特征有关。但这种相关性是否转化为因果关系呢?m6A修饰能影响HCC的行为并帮助预测预后吗?

为了找到答案，中国复旦大学的一组研究人员由秦伦修教授领导，进行了生物信息学分析，以确定特定的m6A签名和相关的调节因子，可以帮助预测代谢状态肝癌的严重程度和预后。谈到代谢改变的重要性，作者秦教授说:“我们之前的工作揭示了代谢功能障碍如何影响HCC的侵袭能力，并可作为治疗干预的目标。现在，我们想知道它们是如何引起的。”

他们的新研究发表在癌症生物学与医学研究人员使用了来自公共来源的数据——癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因表达总汇(GEO)和国际癌症基因组联盟(ICGC)——综合反映表观遗传RNA修饰。共使用605个样本。他们从已发表的文献中鉴定出23种m6A调控因子，其中13种已在HCC中报道。此外，他们还包括与其他癌症相关的m6A调控因子。将调控因子聚类为代谢基团，并对聚类间的生物过程进行分化。他们还开发了一种新的m6A评分来量化在HCC中发生了多少修饰，与其他有助于HCC发病的修饰的联系，以及对索拉非尼(肝癌的治疗路线)治疗的反应。

结果很清楚:肿瘤和非肿瘤肝组织之间的m6A模式有明确的异质性。此外，他们还发现，随着基因数量的增加，基因拷贝的差异也相当大基因表达m6A调控因子在HCC中的表达，并能够将HCC细胞分成3个具有不同代谢谱的簇。

HCC中3种不同的m6A修饰模式均具有不同的代谢特征。M6A簇C1对应于M6A调控因子的低表达，其特点是代谢活性高、肿瘤分期较低、预后较好、对索拉非尼治疗反应较低。相比之下，m6A簇C3的mRNA甲基化异常活跃，m6A调控因子表达增高，代谢活性降低，肿瘤分期晚期，预后较差，对索拉非尼反应较好。m6A簇C2位于C1和C3之间。

作者强调了他们在肝癌预后和治疗方面的主要发现，“这是首次探索肝癌中m6A甲基化异质性的工作。我们还能够确定某些m6A调控因子是不良预后的风险因素，因此表明m6A景观在预测疾病进展和结果方面的潜力。”

总之，本研究增强了我们对m6A调控因子如何影响HCC代谢异质性的理解，并为HCC患者潜在的预后标志物和治疗反应提供了新的见解。