尖吻鲭鲨的基因组分析揭示了有关人类肿瘤抑制基因

轶事报道声称,癌症的发病率在鲨鱼非常低,但没有足够的数据来证实这种断然的估计。一项研究发表在杂志上基因组学然而,提供了强有力的证据的抗肿瘤活性的基因组头灰鲭鲨、Isurus oxyrinchus。

这个大型远洋物种,只要4米,居住在温带和热带海洋世界。它被国际自然保护联盟列为濒危物种,由于主要孔隙类型与数以百计的钩子,工厂延绳钓捕鱼船,捕捉许多动物在一个单一的通过。他们花了两个月在海上,带回数百甚至数千吨的鱼。

渔业观察家与葡萄牙海洋和大气研究所(IPMA)收集各种器官的组织样本从四个灰鲭鲨这些船只。巴西研究人员基因测序的眼睛和肝组织样本,发现的十大最过表达基因在动物的肝脏与人类肿瘤抑制。

“因为这些钓鱼游艇在海上呆这么长时间,一些组织样本的守恒的RNA。我们设法获取遗传物质从四个肝脏和三只眼睛,但即便如此他们得到意外的结果,”罗德里戈domingue说,这篇论文的第一作者。博士后的研究而domingue实习在圣保罗(UNIFESP)联邦大学的海洋科学在其部门在桑托斯,巴西,费尔南多Mendonca的监督下。

domingue执行分析的一部分,他是一个实习生在海洋和环境研究的跨学科中心(CIIMAR)在葡萄牙,还有奖学金FAPESP(圣保罗研究基金会)必须占州政府。这项研究涉及Brazil-Portugal合作项目的一部分,由FAPESP,必须占州政府葡萄牙的基础科学和技术(FCT)。

分析显示3774个差异表达基因的两个器官在眼睛和2162年- 1612年在肝脏。大多数基因过表达的眼睛有关器官的结构和视觉信号到大脑。一些基因与光接收被发现的,这表明尖吻鲭鲨可能只有单色视觉和可以看到颜色相同的颜色,就像所有其他的鲨鱼。

最近完成了基因组测序的大白鲨(噬人鲨属carcharias),最大的鲨鱼,测序显示两组被积极选择的基因与抗肿瘤活性。因此巴西人员吃惊的是发现前十名的过表达基因在灰鲭鲨的基因组中,不少于九个癌症相关。

从结肠癌神经胶质瘤

高于正常活动的基因在肝脏中,已知HABP2减少集落形成和细胞迁移在甲状腺肿瘤,虽然PON3编码一种酶,这种酶可以作为细胞抗氧化剂,保护细胞不受氧化应激,这是癌症的一个重要因素。

NIT2, RMC1 FGFRK1表达在不同组织和潜在肿瘤抑制剂。前两个与镇压结肠癌细胞,而第三对细胞增殖有负面影响在前列腺癌的发生和发展。

ITIH3参与炎性疾病、精神分裂症、抑郁症、心脏病,和胃癌。CBS和A1CF参与结肠癌的发展,卵巢癌,乳腺癌,尽管CBS在神经胶质瘤tumor-suppressant效果,常见的脑癌。SERPIND1扮演了一个角色在鲨鱼快速伤口愈合,炎症,血液凝固,在人类癌症转移。

“找出如果任何化合物从鲨鱼肝可以作用于人体细胞,我们需要做一个提取肿瘤细胞器官和测试。如果这样的生物活性化合物被发现产生一个显著的好处,其他组织合成,可以使用它们来生成一个新的药物治疗使用,”domingue说。

作者指出,尖吻鲭鲨已经被商业过度捕捞船队,其鳍出售给亚洲市场及其在巴西肉类。因此,“我们阻止进一步增加捕捞的物种和人口下降这个额外的目的。另一方面,有可能将研究活动以优化这一濒危鲨鱼的抽样,特别是科学观察人士商船和可以继续采取样本标本已经死了当俘虏,”他们写道。

为该物种的保护,研究人员正在寻找单核苷酸多态性(snp),可作为生物标记定位突变和有助于解释是否有几个在海洋这个或那个人群,例如。如果差异被发现在某些地区200个样本的基因组从大西洋和印度洋,它可能会使用它们来确定海洋因素(水的温度和盐度、叶绿素含量等)导致这种分离到组。如果是这样,可以用来制定渔业政策的信息,包括禁止在某些地区捕鲨。

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