新的,详细的分子路线图提高了对抗子宫内膜癌的斗争
2月13日发表的一项研究细胞提供了一个前所未有的几十个分子步骤,发生导致子宫内膜癌,通常被称为子宫癌。这项研究为医生如何更好地识别哪些患者需要积极治疗提供了见解,并为为什么一种常见的治疗方法对某些患者无效提供了线索。
这项由国家癌症研究所资助的研究还表明,已经批准的药物可能有新的作用目标蛋白质被称为CDK12,SMARCA4和PML以其他类型的癌症。
人们可以说工作是一个详细的分子快照子宫内膜癌。然而,这些信息如此庞大,触摸成千上万的分子演员在不同时间参加数千个交互,那么工作更像是逐帧的视频,记录在患者患者多年多年的步骤身体。
“这就像子宫内膜癌的谷歌地球,”Karin Rodland是本文的五个相应作者之一和美国能源部的癌症生物学家国家实验室。“这是一种非常全面的这种特殊癌症类型的肖像。我们试图衡量我们可能的一切。然后我们搜索了模式。”
Rodland和PNNL的刘涛是本文5位通讯作者中的2位;其他的来自纽约大学医学院、圣路易斯华盛顿大学和贝勒医学院。总的来说,来自十多家机构的科学家做出了贡献。资深作者是纽约大学朗格尼健康中心的David Fenyo。
子宫内膜癌:超越基因
这项研究以癌症基因图谱(TCGA)的工作为基础,该图谱在2013年确定了这种疾病的一些遗传基础。
但基因只是癌症患者的故事的开始。那些基因的时间和地点在哪里打开,关闭或突变?它们是什么生产以及这些产品的互动?
该团队研究了95例子宫肿瘤和49个正常子宫组织样品。科学家测量了令人眼花缭乱的分子玩家阵列的丰富和修改,包括基因,信使RNA,圆形RNA,微RNA和蛋白质。科学家称之为“翻译后修饰”的测量,包括磷酸化和乙酰化,是确定何时且何时蛋白质,每种细胞的分子母素的何种问题是活性或无活性的关键。
“这一独特的,丰富的高质量数据资源来自同一组样品的所有这些分子参与者为癌症研究人员提供了蛋白质活动和调节的珍贵观点,”刘说。
总部占领了1200多万元。
他们从这个艰苦的过程中学到了什么?以下是最重要的结论。
鉴定最具侵略性的子宫内膜癌症
科学家们开发了一个有希望的新方法来识别目前没有被归类为侵略性的肿瘤,但结果与僵硬的肿瘤一样侵入,这迅速增长,比其他肿瘤更可能杀死患者。
现在,通过在显微镜下观察细胞来确定子宫内膜肿瘤的侵袭性。该团队表明某些蛋白质的活动水平明显区分更积极的肿瘤。例如,该团队展示了蛋白质Beta-catenin,如何用已知为Wnt的信号通路,以逃避检测,积聚和刺激细胞来逃避对照的信号传导途径相互作用。
“现在是一个纪律的蛋白质军队现在成为一个暴徒,令人伤害,”罗德兰说。
出乎意料的是,研究小组还发现,在肿瘤细胞中,基因打包和解包的过程比预期发生得更频繁。几乎我们的每个细胞里都有超过7英尺长的DNA,而且排列得非常高效,但细胞需要解开DNA,这样其他分子机制才能进入它。研究小组的测量结果表明,组蛋白乙酰化在子宫内膜癌中非常活跃。
“想象一下一个图书馆员抱着一个非常紧张的书,不允许其他人读它,”罗德兰说。“如果你想阅读书籍 - 或在这种情况下,可以访问一个基因并将其转向它 - 您必须有一种方法来放松图书馆员的握把并打开书籍。”
识别将从检查点治疗中受益或不会受益的患者
该团队创造了一种新的方法来确定哪些患者最有可能从称为检查点治疗的治疗中受益,其中彭洛丽撒和Nivolumab这样的药物用于躲避一些癌细胞用于逃避的障碍免疫系统。这是医生探索使用免疫疗法的许多方式之一,以促使身体的自然防御癌症。
目前在子宫内膜癌中,医生使用称为肿瘤突变负担的测量来确定哪些患者最有可能受益。在本研究中的免疫活动测量的基础上,科学家提出了一种专注于患者的抗原呈现机械的新措施,称为APM。APM描述了身体标志癌细胞的程度如何,并向身体的免疫系统呈现销毁 - 检查点抑制剂有效的关键功能。
更准确地了解哪些人将受益于这种药物将使医生避免在不太可能受益的病人身上使用这种药物,使这些病人免受严重和不必要的副作用。
“这项工作有助于我们为子宫内膜癌患者提供个性化药物,”贝勒医学院的张兵(Bing Zhang)说,他是一名通讯作者。“这些工作将帮助我们了解哪些患者将从哪些疗法中获益最大。”
研究小组还发现,一种常被忽视的环状rna小分子,似乎参与了细胞获得扩散能力时发生的转化。这种转变被称为内皮-间充质转化(EMT);这就是子宫内膜癌致命的原因。
该研究是由国家癌症研究所的临床蛋白质组学肿瘤分析联盟提供资助的一系列研究的第五个出版物,以解决癌症中涉及的生物途径。以前发表的论文集中了卵巢癌和结肠癌。
“这是假设发电研究,”罗德兰说。“这就像月亮使命,船员将岩石带回了许多其他科学家的学习。在这里,我们正在为科学家提供评分的原始信息,以便学习,生成新的假设。最终我们希望这些信息将导致临床试验,也许是治疗这种疾病的新方法。“
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