发现一个主要的技术错误将改善表观生物学研究

罗明大学的外膜遗传学中最广泛使用的方法中最广泛使用的方法之一是误导结果，瑞典Linköping大学的研究人员表明。这可能对研究领域具有重要意义，其中DNA分析的大数据和先进方法用于研究大量的表观遗传数据。在先前收集的DIP-SEQ数据中可以纠正错误，这可能导致来自先前人类表观生物学研究的新发现。结果已在期刊上发表自然方法。

原则上，每个细胞都有相同的DNA序列。然而，不同的细胞使用非常不同的基因组。这意味着需要额外的信号来控制在每个细胞类型中使用的基因。其中一种信号由直接附着在DNA序列上的化学基团组成。这些对DNA序列的化学修饰形成了通常被称为表观遗传编码。外观遗传调节基因在正常人体发展中起重要作用，但也与许多疾病（如癌症）有关。

Linköping大学的研究人员发现，DNA免疫沉淀测序(DIP-seq)是表观遗传学研究中最常用的方法之一。简单地说,这方法是基于挑选出携带特定表观遗传信号的DNA部分。为此，研究人员使用了各种抗体来识别特定的化学结构并与之结合。随后对这些抗体进行分类，并确定它们所结合的DNA序列。内斯特的研究小组注意到，某些表观遗传标记总是出现在同一个地方，即使是在根本不应该包含这些表观遗传标记的DNA中。

“我们的发现强调了在研究中使用高通量技术时，实验验证的重要性。没有这样严格的实验，普遍存在的错误就会隐藏在显而易见的地方，被研究的一致性所掩盖，”临床与实验医学系助理教授科尔姆·奈斯特说，他也是这项研究的首席研究员。

通过分析超过125个现有的数据集Nestor的组，显示DIP-SEQ通常检测到没有任何的DNA序列表观遗传痕迹。这些假阳性占检测到的DNA区域的50-90％，并且效果的大小不同于不同的数据集之间的不同。“现在我们了解这个错误，减少它非常简单。纠正这些错误将允许新的发现由公共领域已经在公共领域的表观遗传数据的财富制成“COLM Nestor。

研究人员指出，以前研究的绝大多数结果是正确的。

“我们应该继续使用这些方法，而是通过使用适当的实验设计来正确的这些错误，”COLM Nestor说。

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