新的生物信息分析显示蛋白质在糖尿病肾病中的作用

加州大学San Diego医学院的研究人员开发的新的生物信息框架已经确定了糖尿病肾病患者的活检组织中的基因表达水平明显改变的关键蛋白质，这可能揭示新的治疗目标。

在最近发表的论文中JCI见解由医学博士库马尔·夏尔马(Kumar Sharma)领导药物据美国加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员透露，MDM2蛋白一直被下调，并在卵巢癌中发挥了关键作用糖尿病肾病进展。研究人员使用新的“MetBridge Generator”生物信息学框架来识别相关酶和桥蛋白，这些酶和桥蛋白在分子水平上将人类代谢组学数据与糖尿病肾病的病理生理联系起来。

“MetBridge生成器允许对糖尿病肾病患者的尿液代谢组学数据进行高效、集中的分析，为研究人员提供了一个基于关键蛋白质可能的细胞或生理作用的新假设的机会，”Sharma说，加州大学圣地亚哥分校医学院代谢组学研究所和肾转化医学中心的资深作者和主任。“该框架也可用于解释来自各种疾病的其他代谢组学特征。例如，MDM2还参与调节肿瘤蛋白p53，而p53是癌症治疗的靶点。”

在先前的研究中，作者确定了13名代谢物，该代谢物被发现被糖尿病肾疾病患者改变。研究人员在代谢途径上结合了这些信息和公开的数据，研究了一些假设，即一些蛋白质充当桥梁产生较少明确的途径。该框架然后创建了一种代谢和蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络的地图。这使得团队能够深入了解相关桥梁，其与调节糖尿病患者的13代谢物签名的酶相互作用的最大相互作用肾脏疾病。

作者已经将蛋白质RNA相互作用鉴定为可能的疾病进展的额外关键途径的可能源，这可以添加到Metsbridge发生器网络中。这种增长将继续增加疾病治疗的可能治疗靶标。

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