开发了生物信息学软件以预测癌症相关突变的效果

研究人员开发了自由软件，分析蛋白质中的突变;这些突变是癌症的潜在诱导剂，如癌症。遗传学家Asier Fultier Fullaondo和JoséAntonioRodríguez和电信工程师Gorka Prieto创建了Wregex 2.0，这是一种多功能和快速的生物信息学应用，能够分析并将来自40,000个蛋白质的信息与一分钟内的空间内的信息相结合。WREGEX 2.0适用于科学界这里和期刊科学报告发表了一篇关于它的文章。

蛋白质由氨基酸链组成，其中可以用离散函数进行短序列，称为“功能图案”。在某些情况下，已经描述了这些图案;其他人尚未指定。功能图案突变可以影响疾病的发展，包括癌症。验证蛋白质的可能变化是导通其功能的第一步之一。如果我们记住，人类蛋白质组的目前草案由40,000多种蛋白质组成，寻求每个人的突变是一个巨大的任务。

因此，三个研究人员开发了生物信息学工具。最初，他们开发了一块软件（WREGEX）来预测并自动寻找功能图案。他们测试了该程序以预测将蛋白质从细胞核移动到细胞的细胞质，所谓的核输出信号的基序。

在2014年在本研究阶段结束时，他们在期刊上发表了一篇论文生物信息学。但是，正如JoséAntonioRodríguez所说，“在研究中，一个问题的答案打开了更多问题的大门。”那个场合的问题是：氨基酸序列中的哪种蛋白质可以具有功能性癌症 - 突变基序？

该团队将所有已知人类蛋白质序列的信息与宇宙目录组合，其指定与癌症相关的突变。因此出现了一种新的版本（WREGEX 2.0），其将具有突变体的正常蛋白质比较，以预测已被修饰的功能基序并且可以与癌症相关联。

“您也可能有一个主题函数的经验，并且您希望了解它可以出现的蛋白质，以及它是否出现修改为癌症。通过这个软件，您可以获得候选人开始学习，”Gorka Prieto解释说。

一旦开发了生物信息学计划，就必须进行测试。为此，他们进行了细胞出口审判。它们选择了各种候选者，该候选者可以构成负责在细胞核外移动蛋白质的主题。根据宇宙目录中描述的肿瘤突变修改它们后，它们再次运行试验。这样，他们证明候选人担任出口信号，确保突变影响了他们的工作方式，因此该软件有效。

该工具结合了三种类型的信息：蛋白质序列，功能基序和癌症突变。“WREGEX 2.0的主要特征之一是它可以同时研究高度复杂的蛋白质蛋白质，并在试验的情况下与癌症突变结合信息;但门打开了使用包含关于其他信息的其他数据库突变的类型。此外，优点是可以分析40,000个蛋白质，同时随着其他程序，单个蛋白质的分析花了几分钟，“解释为期春天。通过该软件，可以预测变更蛋白质可能影响疾病的发展，而不仅仅是癌症。

到目前为止，13件研究已经使用了这个计算工具。中国，日本，韩国，德国和美国的研究人员已访问服务器。与此同时，研究人员已经在考虑继续进行改进工具的工作。

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