报道了首次用于临床决策的全基因组癌症检测的大规模试验

首次，研究人员进行了大型试验，他们测试了个体乳腺癌的整个基因组，以帮助个性化治疗。他们在维也纳欧洲医学肿瘤学会的Esmo 2012年发布了他们的调查结果。

近年来，已经开发出许多靶向特异性药物基因改变在癌症中。选择这些药物中的哪一种适合个人耐心,一些基因检测执行。法国维勒瑞夫古斯塔夫Roussy研究所的法布里斯博士André说:“在大多数情况下，这些基因检测方法只分析了有限数量的基因。”

全基因组测试的理论好处是，这种方法可以识别频繁和罕见的意外基因组事件。André博士说:“此外，它使我们能够量化基因组不稳定性的水平，并检测驱动突变是否与与靶向药物耐药相关的基因组改变有关。”

而言,卫生保健供给政策上，发展全基因组方法也意味着新的生物分析方法不需要针对癌症中发现的每一个新目标设计。

在SAFIR01试验中，André博士和他的同事开发了一个项目，在这个项目中，对转移性乳腺癌患者的活检组织的整个基因组进行了前瞻性分析。他们使用阵列CGH (aCGH)和桑格测序来确定转移组织中的基因改变，这使他们能够确定哪些基因发生了突变、扩增或删除。这些基因组信息被前瞻性地用于提出不同的靶向治疗。这项研究由UNICANCER主持并赞助，由法国资助国家癌症研究所。

截至2012年9月23日，402例患者进行了活检乳腺癌患者，包括26名正在进行分析的患者。其中，276例患者可获得基因组结果，其中248例可进行全基因组分析。André博士说，在172名患者中发现了一种抗癌药物“可靶向”的基因改变。有趣的是，约20%的患者出现了非常罕见的、有时出乎意料的基因组改变，这凸显了全基因组方法的必要性。

“主要的信息是，全基因组方法可以在大队列的日常实践中提供，使我们能够识别在很大比例的患者中可以抑制的靶点，从而产生抗肿瘤效果。这项研究表明，将个性化药物引入癌症领域的时机已经到来。”André博士说。

虽然自活检以来只有少数患者需要实验性药物，但迄今为止已有26例患者接受了与基因组改变相匹配的靶向药物。其目标是为80多名接受靶向药物治疗的患者提供治疗。

“当收集SAFIR01试验及其试点阶段的结果时，48名患者中有18名按照整体进行治疗基因组分析提供了抗肿瘤活性的证据，”André博士说。

André博士总结道:“我们认为，在未来，癌症基因组检测的全基因组方法将成为治疗的标准，因为它们提供了基因组改变的广泛图景，并且是测试生物标志物的简单方法。”

彼得Dubsky博士评论数据,维也纳医科大学外科副教授(他并没有参与研究)说:“SAFIR01是一项非凡的成就,个性化的乳腺癌的分子解剖进入设置,原则上,转移到临床实践。”

杜布斯基博士说:“研究人员已经能够分析个体乳腺癌基因组的大部分，而且还成功地识别了分子改变，这些改变很有可能对特定治疗产生反应。”“换句话说，他们创造了一种可能性，在显示转移性疾病进展的女性中识别‘可用药’的靶点。”法国联盟克服的技术成就和组织和伦理障碍都代表了致力于临床相关研究的最佳状态。”

Dubsky博士说:“法国财团为晚期乳腺癌的更个性化治疗打开了一扇新的大门。”“与目前的标准相比，临床研究必须解决此类方法的临床效用。”

有几个问题仍有待讨论，Dubsky博士说:“这个问题活检转移（特别是为了获得高质量的DNA）并不总是可行的，价格昂贵，可能导致额外的发病率。鉴于下一代测序技术最近的见解，值得询问来自转移性部位的相关组织是如何。换句话说，在未来将来自初级的新组织足以筛选药物目标？“

“提及乳腺癌亚型的定义也很重要，这已经是治疗晚期和早期疾病的临床现实。肿瘤学家能够根据激素受体来剖析乳腺癌亚型，HER2-NEU和标记的表达肿瘤的分化和增殖。必须将全基因组方法与临床效用方面的当前黄金标准进行比较。“

最近，使用MTOR抑制剂与Exemestane组合的PI3K / MTOR途径的靶向导致转移激素受体阳性和HER2NEU阴性的妇女临床益处的重大改善乳腺癌Dubsky博士说。“值得注意的是，这个目标是基于分子研究的。然而，从这种新的治疗组合中获益的患者是临床选择的:对先前的内分泌治疗产生内分泌耐药性的女性被选择，并显示出显著的临床获益率。提供这一证据的临床试验是成功的，没有单个分子的治疗鉴定目标。"

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