一种快速、准确、无需设备的SARS-CoV-2及其变体诊断检测方法

一种快速、准确、无需设备的SARS-CoV-2及其变体诊断检测方法
SHINEv。2是一种基于crispr的SARS-CoV-2及其变体诊断测试,只需5个简单步骤即可完成。描述的是SHINE v2的一个版本,它通过类似于其他病毒家庭测试的方法读取其结果。资料来源:麻省理工学院和哈佛大学博德研究所的Jon Arizti Sanz

sars - cov -2继续在全球传播。检测病毒及其变体有助于限制传播并为治疗决策提供依据,因此是公共卫生应对措施的重要支柱。

现在,来自普林斯顿大学、麻省理工学院布罗德研究所和哈佛大学的一组研究人员创造了一种易于使用的方法这种方法比常用的家庭抗原检测更敏感,还可以在护理点快速和特异性地检测SARS-CoV-2变体。这项研究于2022年5月30日发表在该杂志上自然生物医学工程

普林斯顿大学分子生物系助理教授卡梅伦·梅尔沃尔德说:“病毒感染往往很难检测,就像我们在SARS-CoV-2大流行的早期意识到的那样。”

这种改进的检测方法与我们更熟悉的基于临床的PCR或家用抗原检测方法不同,它使用不同的机制来检测病毒。相反,该测试使用一种被称为CRISPR的技术来检测病毒,这种技术已广泛应用于基因编辑。CRISPR起源于细菌用来检测和防御的系统,并且特别适合快速识别特定的基因序列。

Myhrvold此前曾与Broad研究所成员、哈佛大学教授Pardis Sabeti合作开发了一种基于crispr的测试,可以用于诊断特定的病毒感染。在2020年的第一波大流行之后,迈尔沃尔德的研究团队修改了他们的测试方法,他们称之为SHINE,以极高的灵敏度检测SARS-CoV-2。

“SHINE最初的版本更像是一个基于实验室的测试,”Myhrvold说。“我们希望能够在实验室之外进行测试,最终目标是让人们能够在家里进行自测或测试。”

Jon Arizti-Sanz是哈佛-麻省理工健康科学与技术联合学院医学工程专业的研究生,Myhrvold是他的导师两位科学家的研究团队之间的合作,以改善SHINE。首先,该小组专注于消除对专门设备的需求,以准备患者样本进行测试。接下来,他们优化了测试,使其试剂不需要保存在冰箱中,这确保了测试可以很容易地远距离运输。

他们将改进后的测试命名为“shinv .2”。在确认改变后的测试在他们自己的实验室工作良好后,该小组将一个测试包送到尼日利亚的一个实验室,看看它是否能在长时间的运输中存活下来,并仍然保持其准确性和灵敏度。它做到了。但随后又出现了一个新的挑战需要团队解决。

“当我们致力于《SHINEv》时。2、新的SARS-CoV-2变种出现了,所以我们想对它们进行测试。”

该团队能够迅速适应SHINEv。2,以区分患者样本中由Alpha、Beta、Delta或Omicron SARS-CoV-2变体引起的感染,并表示该测试可以快速修改,以检测可能出现的任何其他变体。

杜兰大学智能分子诊断中心主任、Weatherhead校长Tony Hu说:“数据表明,这种方法可以通过基因组突变的差异检测来区分令人关注的SARS-CoV-2变体,这可以使我们更好地为下一次突变的出现做好准备。”胡审阅了手稿自然生物医学工程

因为它一次测试不同的变体,这种测试需要一种特殊的,但相对便宜的设备来读取结果。尽管如此,SHINEv。与目前用于识别SARS-CoV-2变体的方法相比,2的执行速度要快得多,所需的设备和专业知识也少得多。该团队设想,它将主要用于医生的办公室,甚至是那些偏远地区资源有限的办公室,以帮助医生确定哪种病毒折磨他们的病人,并制定适当的治疗方案。

该团队还想创建一个人们在家也能使用的测试版本,这意味着对其进行优化,这样就可以在没有任何特殊设备的情况下进行测试。

Myhrvold说:“我们创造了一个完全不需要设备的版本,可以通过身体加热来孵化反应,将其放在腋下或室温下。”“我们的目标是尽可能减少对供暖的需求。”

胡教授说:“作者报告的方法提供了一种只需最小样本处理或加热的方法,可能会对流行病控制做出重大贡献。”

家庭测试不能区分不同的病毒变体,但在这个版本的SHINEv中涉及到最小的样本处理。2对家庭用户来说是一个福音——尤其是这种检测方法可以准确地检测出高灵敏度的感染,可以发现其他类型的家庭检测方法可能遗漏的病例。Myhrvold对SHINEv持乐观态度。2人很快将加入对抗SARS-CoV-2以及未来出现的任何其他新病原体的战斗前线。


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更多信息:Jon Arizti-Sanz等人,基于cas13的简化检测方法用于快速识别SARS-CoV-2及其变体,自然生物医学工程(2022)。DOI: 10.1038 / s41551 - 022 - 00889 - z
所提供的普林斯顿大学
引用:快速、准确、无设备的SARS-CoV-2及其变体诊断测试(2022,8月16日)检索于2022年9月17日从//www.puressens.com/news/2022-08-fast-accurate-equipment-free-diagnostic-sars-cov-.html
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