ACMG更新到辅助发现基因列表添加了五个基因，其中一个与心力衰竭有关

美国医学遗传学学院（ACMG）已发布了推荐的最低基因列表的更新，以报告次要发现（SF）的报告。2021年，ACMG董事会和次要调查工作组（SFWG）宣布该学院每年更新列表（SF V3.0）。今天的更新（SF v3.1）添加了五个新基因 - 四大基因与扩张的心肌病易感性相关，并且与遗传性甲状腺雷蛋白淀粉样变性相关，这是心力衰竭的原因。

该论文“ ACMG SF v3.1报告了临床外显子和基因组测序中次要发现的清单：美国医学遗传学和基因组学院（ACMG）的政策声明“代表了自上次更新以来SFWG的工作，该作品与上次更新相比，与在生物医学伦理学方面增加了专家，而另一种人群中的遗传疾病则增加了。该论文发表在ACMG的官方杂志上医学遗传学。

“ v3.1列表是我们正在进行的年度更新中的第一个，并体现了我们工作组的目标，即保持最低可行的结果清单，以积极的方式影响患者及其家人，”首席作者和联合主席说。ACMG SFWG，David T. Miller，医学博士，Facmg。

FACMG和SFWG联合主席Christa L. Martin博士补充说：“我们认识到，道德问题在基因组学和多样性中也很重要，因此我们在SFWG中添加了两个新成员，一个在生物医学伦理学方面具有专业知识，另一种在不同人群中具有遗传疾病的专业知识。它们的贡献对这一更新起了重要作用。”

原始ACMG偶然性政策声明的指南（稍后更新到当前术语“次要”）发现，2013年确定了执行外显子群落或基因组测序应在一组被认为是医学可起作用的基因组中报告已知病原或预期致病变异的“最小清单”，即使与主要的医学原因无关。2021年5月，ACMG的SFWG发布了“ ACMG SF v3.0列表，用于报告临床外显子和基因组测序中次要发现的报告：美国医学遗传学和基因组学院的政策声明，其中包括73个基因，是最多被引用的基因，并且是一个被引用的基因ACMG去年发表的文章。

ACMG SF v3.1添加了五个基因

自从心力衰竭（HF）（HF）和突然心脏死亡（SCD）的首次迭代以来，心血管基因已在SF列表中表示，SF v3.1 SFWG投票通过了四个与扩张相关的基因心肌病（DCM）倾向：TNNC1，RBM20，BAG3和DES。该决定是基于证据表明，所有四个基因都显着使DCM倾向于以类似或更高的发病风险和死亡率与其他DCM基因相似或更高的风险，列表的先前迭代中已经包含。

添加到SF v3.1列表中的第五个也是最后一个基因是TTR（transthyretin）。先前已由SFWG审查了TTR相关的淀粉样变性，但在SF V3.0列表中不包括在SF v3.0列表中，TTR被重新考虑并包含在此更新中，这是由于人口流行和FDA批准的治疗方法的可用性。

在对TTR的讨论中，SFWG发现了与其在基因组学研究中不足的祖先群体中更为常见的遗传变异背景下其已建立标准相关的细微差异。SFWG考虑的评论由社区提交，观察到遗传性甲状腺素蛋白淀粉样蛋白（HATTR）与遗传性血色素肿瘤有许多特征，这种遗传性血色素肿瘤病具有相关基因（HFE）的疾病（HFE），已经在SF V3.0上。两种情况都是进行性浸润性疾病，导致最终器官损害，包括心肌病。然而，尽管欧洲血统的个体中存在最常见的致病性变异，但TTR中最常见的致病变异是西非血统的个体中特别高的频率。

虽然疾病的稀有性和致病变异的渗透性是SFWG在添加基因或遗传变异类时考虑的因素，但作者指出，工作组“确定与不成比例影响一个或不成比例的条件相关的基因如果少数化的群体在美国人口中罕见或较低的渗透率将不会受到惩罚。换句话说，我们在特定人群的背景下评估稀有性和渗透率。”

考虑但排除在ACMG SF v3.1中的基因

该论文还提供了三个背景癌症风险/血液学基因被认为但最终从SF v3.1更新中排除在外：Runx1，rad51c和rad51d。

由于本文所述的三个原因，该工作组投票赞成不包括Runx1，包括有关基因组确定的（而不是基于家庭或基于诊所的）同伙的渗透率和患病率的有限数据。

先前，对RAD51C/D列出了有关其与卵巢癌风险的关联的ACMG SF V3.0列表。由于最近进行了两项大型种群乳腺癌研究，该工作组在乳腺癌风险方面重新审视了这些基因。为省略RAD51C/D提供了理由。SFWG已经在讨论其他适度的乳腺癌基因，并确定了“保持最低列表的标准基因为了建议返回和“像案件一样对待”。