对乳腺细胞进行分类以发现癌症的起源

如果你能预测哪些细胞会癌变呢?在女性的一生中，乳房组织会发生巨大的变化，因此找到可能导致癌症的突变标记尤为困难。冷泉港实验室(CSHL)副教授卡米拉·多斯桑托斯(Camila dos Santos)和她的团队鉴定并分类了数千种正常的人类和小鼠乳腺细胞类型。新的目录重新定义了健康的乳房组织，这样，当出现问题时，科学家们可以精确地找到它的起源。

任何胸部细胞可能变得癌变。Dos Santos说：

“要了解乳腺癌的风险，你必须了解正常乳房细胞首先，当我们考虑预防性甚至靶向治疗时，你会阻止正确的细胞类型发展成癌细胞。"

通过跟踪几个签名来传统的目录单元格基因与细胞的功能有关。为了更广泛地对细胞进行分类，dos Santos的团队转向了一种被称为单细胞RNA测序的技术。他们追踪了小鼠和人类乳房组织中超过15000个细胞中几个基因的活动。石溪大学多斯桑托斯实验室的常驻研究生萨曼莎·亨利(Samantha Henry)说:

“我们确实为每个细胞群体创建了许多基因的完整目录，以便更好地定义它们。当我说有很多基因的时候，确实有很多基因，这花了很长时间。”

一种细胞组包括雌激素受体阳性细胞，其通常可用于处理。但是Dos Santos的团队发现，该组可以分为几个群体，其中每个群体可能对治疗有不同的反应。

该团队与计算生物学家CSHL教授Adam Siepel和他的团队合作，发现小鼠和人类乳腺细胞有相似的基因图谱，这说明了为什么在小鼠身上进行的研究可能与人类相关。dos Santos实验室的计算机科学开发人员Marygrace Trousdell说:

“我们总是发现自己很难对某些细胞类型进行明确的分类。有时我觉得我已经看到了所有的基因，然后其他的就会冒出来。”

目前，该实验室正试图将正常的基因转移与与癌症相关的基因转移区分开来。多斯桑托斯希望她的乳腺细胞类型目录能指出需要监测的细胞类型，并为研究人员指明未来的治疗方案。

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