3月9日，2021年3月9日

如何发现南非Covid-19变体

新型冠状病毒的变种正在世界各地出现，其中许多正在以惊人的速度传播。一种传染性变异是南非变异，或SA，由一个国际研究团队确定，包括来自加州大学河滨分校的生物医学科学家。

“新的Covid-19变体是下一个新的边疆，”UC河畔医学院的生物医学科学教授Adam Godzik说，发现了发现的研究团队成员。“其中，SA和巴西菌株最令人担忧。它们具有使其耐抗体的突变，使我们用现有疫苗产生抗体。通常相信我们处于紧张的比赛中：除非我们迅速接种人民，否则粉碎大流行，新的变体将占主导地位，这一点是我们的Covid-19疫苗都是无效的。“

两年前加入了他的实验室的博士和阿尔吉望Alisoltani-dehkordi，通过使用计算机模拟提供其尖刺蛋白质结构，帮助表征了新的SA变体。

研究结果今天发表在自然。

在她加入UCR之前是南非大都会镇大学的博士后研究员，提到了南非夸祖鲁 - 纳塔尔大学和开普敦大学的研究团队发现了新的谱系或变体-Of SARS-COV-2，导致Covid-19的病毒，来自10月15日至11月25日之间的样品，在三个南非省份。截至11月初，这种变体迅速成为两省样本中的主要变种。

“每一个SARS-CoV-2变种都有特定的突变来定义它，”Alisoltani-Dehkordi说。“Godzik教授和我使用计算机建模提出了SA谱系中突刺蛋白突变可能的结构和功能后果。我们的分析也得到了其他几个研究小组的证实，我们的分析显示，一些突变可能导致病毒的传播性更高，免疫反应更弱。”

在包括美国的至少40个国家，已检测到SA变体。

Godzik说:“这种变异可能在尚未测序的地区传播，因此无法识别。”“在美国，测序仍然是一个缓慢的过程。在美国的很多地方，包括河滨，我们没有任何关于变异的信息。”

对SA变体的初步研究表明它可能对抗体耐药，这可以降低疫苗的功效。

戈德齐克说:“从那时起，它就引起了高度的兴趣。”“随后的研究证实它对疫苗有抗药性，并且正在传播。然而，南非在通过隔离和其他措施控制病毒变异方面做得很好。”

所有新出现的SARS-COV-2在英国，南非，巴西和加利福尼亚州的关注变体都表现出普遍的突变签名。但这些变体中的每一个也具有一组独特的突变。例如，SA和巴西变体分别在穗蛋白K417N和E484K上具有两个独特的突变。

Alisoltani-Dehkordi说:“我们的初步发现表明，一些突增突变可能与SA变异的传播能力增加有关。”“然而，这一新谱系中spike和其他基因组突变的全部意义还有待确定。”需要强调的是，我们没有足够的证据证实SA系与其他系相比有更高的疾病进展、严重程度或死亡率。但与野生型相比，SA谱系和其他最近出现的谱系的高传播性和不寻常的差异，对系统监测SARS-CoV-2毒株和在它们演变为疫情之前早期发现变异产生了很高的需求。”

戈德齐克解释说，不存在单一的COVID-19病毒。相反，一群不断进化的病毒存在着。变体也会进化，也会获得突变而且随时可能发生病毒逃逸。