新的,有效地简化了基因测试屏幕遗传性癌症

科学家开发出了一种新的综合遗传/表观基因DNA测序协议称为MultiMMR可以识别的存在,导致错配修复(MMR)缺乏症在单个测试从一个小样本的DNA在结肠,子宫内膜和其他癌症。这个替代复杂的、多步骤的测试工作流还可以确定MMR经常遗漏的缺陷的原因目前的临床试验。提出了他们的研究结果分子诊断学杂志。

MMR基因检测和修复错误可以发生在正常细胞的复制和重组。在一些与生俱来的和后天习得癌症,一个或多个MMR基因失效。“MultiMMR的影响是广泛的。肿瘤与新MMR缺乏反应良好癌症免疫疗法,”首席研究员解释道特雷弗·j·普博士,医学生物物理学、多伦多大学;玛格丽特公主癌症中心,大学健康网络;安大略癌症研究所,多伦多,加拿大。“决定一个人是否有一个继承形式的MMR不足也可以允许临床医生登记病人积极的监测,开展风险评估策略,并提供基因检测relatives-potentially改善患者的结果。”

MMR的标准临床试验缺乏可以不一致,需要多个测试和类型的经验,导致次优的照顾病人。下一代测序检测得到普及和在临床实验室使用。然而,他们不确定所有缺MMR基因变异,和额外的测试通常是必需的。

MultiMMR同时检测启动子甲基化,突变,拷贝数状态,复制中立的杂合性丢失,从少量的DNA和微卫星不稳定。在这项研究中研究人员从142年测序DNA标本60(82正常和肿瘤样本)从82年MMR-associated直肠癌患者,子宫内膜癌、脑癌。积极的控制,结果与之前相比45例临床试验使用常规化验。他们还使用了MultiMMR概要商用DNA控制,包括11个变种,挑战与下一代测序检测。

发现MMR的存在缺陷,MultiMMR启动子甲基化和微卫星不稳定性分析发现,95%和97%一致的临床测试,分别。在检测变异负责MMR不足,MultiMMR匹配的临床测试结果在23个24例。的测试确认所有11个突变合成多个测序运行混在一起,并确定了错配修复缺陷患者29个不完整或不确定的测试。MMR的面板是能够识别原因经常遗漏的当前临床级联。

“我们已经表明,MMR的存在和原因可以确定在一个测试中,从一个整除的DNA,从而充分利用可用的组织,简化工作流程,并提高综合报告(merrill Lynch)和相关遗传癌症,”评论作者莱斯利奥德菲尔德,MSc,医学生物物理学、多伦多大学;大学健康网络和玛格丽特公主癌症中心,多伦多,加拿大。

研究人员指出,当前级联测试协议可能无法满足日益增长的需求普遍肿瘤检测大肠癌患者和子宫内膜癌。许多下一代测序测试没有屏幕微卫星不稳定例如,和启动子甲基化与体细胞突变。

“资格免疫疗法往往是取决于MMR状态,所以及时的和健壮的测试是很重要的,”奥德菲尔德女士补充道。”MultiMMR简化了过程和不同类型的MMR不足与改进的周转时间,可以很好地扩展增加需求,并且可以为临床医生提供重要信息告知病人管理和治疗的决定。”

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