科学家们敦促,要结合化学探测资源来优化生物医学研究ob欧宝直播nba

一份新报告敦促生物医学研究人员非常仔细地使用ob欧宝直播nba在线网络资源,考虑到他们选择的小分子化学探针,以帮助回答他们的研究问题。

在今天发表的“特别报告”期刊中未来的药用化学今天(星期四),伦敦癌症研究所研究所的科学家开展了对所有公开的资源的第一次全面评估

该报告强烈建议研究人员应避免一般搜索引擎和供应商目录信息,而是使用两种在线资源 - 专家评论和计算大数据方法 - 以便做出最佳决策在生物医学研究中使用的探针,并避免了可能ob欧宝直播nba导致不正确结论的工具选择。

小分子化学探针是科学家们广泛使用的重要工具,用于修饰——通常是抑制——分离细胞或有机体中单个蛋白质的活性,从而确定其功能。化学探针也被用于测试特定蛋白质在疾病(如癌症)中的作用,并帮助验证该蛋白质作为未来药物的靶点。

小分子探头提供了替代遗传技术的替代方法,如RNA干扰和克切,实际上,在用在一起时使用的化学和遗传方法是非常互补的,高度有效。

不幸的是,许多已要求保护的小分子化合物作为化学探针,并且通常非常广泛地使用,对感兴趣的蛋白质不够特异,并且使用它们可以产生不正确的结果。有些化合物达到了一些额外的蛋白质目标,而其他化合物则袭击了很多其他蛋白质目标。

迫切需要提供具有适当信息的生物医学科学家,以便他们可以为其实验选择最佳的化学探针,有助于确保其研究结果是强大的。

一项重大挑战是,潜在化学探针的信息分散在许多不同的科学出版物和其他来源中,这使科学家难以做出完全了解的选择 - 特别是如果研究人员不是化学生物学,药理学或药物发现的专家。。幸运的是,通过在化学探针上开发公开的在线资源,帮助在过去几年中发出了帮助。

癌症研究所的化学探测器团队(ICR)讨论了提供信息,以指导化学工具的选择 - 发现它们都有自己的优势和局限性。他们为如何导航这些资源提供用户友好的建议,为研究人员的需求选择最佳的化学探针。

报告强调了提供化学探针专家评论的资源的价值。它特别强调了化学探针的门户,化学生物学专家目前提供192种化学探针对181种不同的感兴趣的蛋白质的评估,并提供如何最好地使用它们的建议。该门户网站还提供了大约200种其他不应该再使用的小分子化合物的信息,尽管其中许多可能在过去被广泛使用。

但依赖专家对同行评审的资源也有一些局限性。例如,对化学探针门户评估的大多数探针对特定蛋白质家族(激酶,G蛋白酶偶联受体,磷酸二酯酶,表观遗传酶和BCL2家族成员)以及许多其他蛋白质家族尚未覆盖。此外,迄今为止保持这些资源并不是那么容易,因为他们依靠从志愿者评论者的手动输入。正在进行更改以解决这些点并对门户进行其他增强。

该报告还强调了利用大规模定量计算分析提供了对化学探针提供客观评估的有用性。它突出了2017年ICR研究团队推出的公共网络资源,并从惠康提供资金。探针矿工有几个关键优势。它是客观的,数据驱动,定量,非常全面的基于生物活性数据,用于超过300,000多种作用于超过2,300名人蛋白的小分子。潜在的数据库经常更新,确保使用最新信息进行分析。

但研究人员还警告说,可以从这些计算系统中错过一些数据来源和化学探针 - 以及探针的排名可能难以解释缺乏化学生物学专业知识的生物学家。

该报告的结论是,继续加强在线资源将改善优质化学探针的选择,并增加生物医学研究的稳健性。ob欧宝直播nba它建议互补的专家审查和计算数据驱动资源应与彼此一起使用,以确保最佳决定使用哪种化学工具 - 并且这可能需要解决当前滥用的主要问题生物医学科学与药物发现的化学探针。

作者还承认,使生物学家了解可用的资源并鼓励其使用存在重大挑战。他们鼓励研究人员,研究资助者,期刊和供应商在报告和吸收中广泛传播,提高生物医学研究的质量和稳健性。ob欧宝直播nba

学习伦敦癌症研究所数据科学主管波西安·拉兹尼教授比绍,伦敦,说:

“化学探针是生物医学研究中的重要工具,在理解蛋白质如何工作以及它们对癌细胞的影ob欧宝直播nba响方面起着关键作用。这些化学工具也经常为发现新的抗癌药物的活动提供动力。因此,科学家们在为他们的实验选择化学探测器时,仔细和彻底是至关重要的。如果不这样做,可能会导致不可靠或误导性的结果。

“在过去的五年中,我们已经看到了将所有可用数据的努力提高,包括我们自己的数据驱动资源,包括我们自己的数据驱动资源探测矿工。

“在我们对各种在线化学探针资源的回顾中,我们发现它们都有各自的优点,而大数据方法是汇集最新证据的重要一步。我们真的需要结合不同来源的信息,这样研究人员就能获得关于化学探测器的最好信息。”

研究联合领导者Albert Antolin博士,伦敦癌症研究所的系统药理博士·霍恩博士博士博士博士博士博士博士(Systems Pharmacolocoloculation)表示:

“为了对研究有用,化学探针实际上必须比治疗病人的许多药物对目标更有选择性,而治疗的有效性和安全性是最重要的标准。”如果研究人员想要找出一种特定蛋白质在人体内或疾病中的确切作用,那么对几个目标的作用可能会被误导或完全不可接受。

“有关于潜在化学探针的大量信息,但这些信息以不同的格式传播,因此生物医学研究人员需要帮助找到最佳的高质量化学工具。”ob欧宝直播nba

研究伦敦癌症研究所首席执行官Paul工人教授Paul工人说:

“化学探针的选择和使用不当会导致不正确和误导性的结果。在一些案例中,劣质化合物的使用导致科学家们完全走上了错误的道路,浪费了宝贵的时间和资金,甚至有时延缓了治疗病人的药物的发现。

“我们非常重要,我们传播了关于暗示最佳化学探针的重要性的重要性这样,我们就可以停止使用过时的工具,并确保生物医学能够带来强大、可靠的结果。

“使用专家策划的化学探针资源以及由大数据方法提供动力的人是选择右侧的最佳方式根据最新的证据。我们敦促研究人员、资助者、科学期刊和供应商利用报告中的建议。”


进一步探索

新的“TripAdvisor”网站,以满足不合标准的生物医学研究工具ob欧宝直播nba

由...提供癌症研究所
引文:将化学探测资源结合起来优化生物医学研究,科学家敦促(2019年11月28日)从Https://meob欧宝直播nbadicalXpress.com/news/2019-11-combine-chemical-probe-resources-optimize.html检索到4月16日2021年4月16日
本文件受版权保护。除以私人学习或研究为目的的公平交易外,未经书面许可不得转载任何部分。内容仅供参考之用。
2股票

反馈到编辑

用户评论