更好的样品,更好的科学:新的研究探讨了研究标本的完整性

更好的样品,更好的科学:新的研究探讨了研究标本的完整性
依赖于准确测量血液中存在两种形式的蛋白白蛋白的相对比例的新试验,在杂志中描述了分子和细胞蛋白质组学。资料来源:亚利桑那州立大学

疾病的有效诊断和治疗需要艰苦的研究,而研究往往依赖于生物样本。大量用于更好地了解疾病和设计有效疗法的研究耗资数十亿美元,并可能影响数百万人的生命。

所以,我们有理由假设,准确的结果依赖于此,对此值得关注

据亚利桑那州立大学的Biodesign Virginia G. Piredia G. Pirecia G. Pirecien G. Pirecer中心的研究人员说。假设是错误的。

“在文献中有这么多发现生物标志物(早期疾病的疾病指标)的主要原因之一,但是确认这些发现的积极验证是这样的事实,即在发现期间的许多情况下,使用样品历史或完整的诚信是简单的。“

随着时间的推移,生物样本很容易发生变化,这通常发生在从深度冷藏中取出时。降解的样品在研究中可能产生虚假的结果。为了解决这些问题,博尔赫斯和他的同事设计了一种高度敏感的测试,可以用来建立血浆和血清的完整性,这是医学研究中最常用的生物样本。ob欧宝直播nba

确保已正确处理此类样品是仔细研究的第一步,满足必要的高度可靠性和再现性。最近在杂志中描述了新的测试,依赖于准确测量血液中存在两种形式的蛋白白蛋白的相对比例的新试验分子和细胞蛋白质组学

休斯顿,我们有麻烦了

在他自己的研究过程中,样本质量问题的即时性对博尔斯显而易见,这参与了国家健康研究所(NIH)分布的生物样本的实验。“我们有点怀疑,有些东西对样品集不太正确,”他说。Borges将新设计的测试应用于样品,令人惊讶的结果。“低且看到,这种标本完整性标记的病例和控制之间存在重大区别。”

进一步的调查显示,储存对照样品的冰箱在一次自然灾害中断电了好几天。“这些信息对于样本的质量和其中标记物的稳定性非常重要。”

这种差异的含义显然超出了他自己的研究。“谁知道什么是其他标记只是因为案件和控制处理的方式而有所区分,”Borges说

潜伏在表面之下

仅在2018年,国家卫生研究院的Medline研究所签订了近百万发布的与健康相关研究论文。依托研究结果的进展转变了医学科学,从而提高了生活质量,从可怕的疾病和痛苦中拯救了数百万。

但进步并不总是顺利。除了研究人员面临的强大科学挑战之外,政治考虑和职业问题还会影响科学如何完成。在科学期刊中发布调查结果的压力往往重视研究人员,并且被认为是对一个年轻科学家职业生涯的进步至关重要。虽然植根于职业生成,但发布或灭亡的越来越竞争的驱动器可以掩盖对数据可靠性的担忧。

长期以来被认为是理所当然的,随着许多研究面临重新审查和更严格的审查,科学可重复性的问题最近已经成为科学实践讨论的前沿。发表的研究结果有多可靠?它们能被复制吗?最近的一本书exposé指出,围绕科学可靠性的问题比以前认为的更加深刻和令人担忧。

在寻求可靠的科学中,生物样本是归零的,但希望发布他们的工作的研究人员可能有一个伪造的时间来探讨他们标本的完整性。如果他们发现问题,它可能会将数据抛入问题并排除出版物 - 一个严重的挫折,几乎没有研究人员展示它。有一种无知的危险是幸福的心态。

知道你的标本!

正如Borges注意事项,解决问题需要两件事。首先,像NIH这样的监管机构需要发出严格的指导原则,包括样本历史和处理的详细文件。目前,一些科学期刊确实需要在出版之前进行样本储存条件的文件,但这种记录通常不足以确保高水平的样本完整性。其次,研究人员需要可靠的方法来测试其样品,以确保它们满足严格的标准。目前研究中描述的技术是朝这个方向的重要提前。

根据给定血浆或血清样品的性质和目的,即使在收集,加工,储存和处理中也会轻微波动会影响质量和可靠性。影响这些样本的许多因素中最重要的是它们在解冻条件下花了-30O C.这也是在许多情况下跟踪时间的更具挑战性的变量之一。

最近突出了样品完整性问题的一个临床示例涉及HER2,是用于诊断乳腺癌的关键生物标志物。最近发现该标记是高度不稳定的,并且在施加到样品组织时可以产生众所周知的结果,除非它在手术切除后1小时内加工。

QC的血

新的生物标志物为血浆和血清的截止值设置,允许研究人员轻松评估样品的质量及其适合于给定实验的适用性,即使样品处理和存储的详细记录是不可用的。首次,血浆和血清 - 可以用可靠的生物标志物跟踪医学研究最常用的生物开发。ob欧宝直播nba

这种生物标志物依赖于两种白蛋白异构体的相对比例,只需要少量血浆或血清和少量样品制备。(这种蛋白质的不同异构体在功能上是相似的,但在体外发生的一种异常程度的氧诱导修饰被用来识别处理不当的样本。)

白蛋白是血浆和血清中最丰富的蛋白质,约占这些生物液体中所有蛋白质含量的一半。在体外,天然的未经修饰的白蛋白随着时间的推移而被氧化。这可以通过观察蛋白质质量的变化来检测,使用质谱。

通过描述发生在血浆和血清中的蛋白质氧化反应的化学速率定律,生物标记物就像一种分子秒表,可以精确地测量特定样本保持解冻状态所经过的时间。

所描述的生物标志物廉价,简单且快速使用,可以完全自动化,使其成为血浆和血清分析的新金标准的强烈候选者。它能够检测到室温条件下的生物开发,只需2小时,快速准确地识别误操作或错误存储的样品并防止它们纳入临床研究。

该研究是与马里科帕县医院合作进行的。患者研究样本是在心脏病专家基督教博士和他的员工的帮助下获得的。

除了更常规的临床研究外,新的生物标志物还准备在各种与健康相关的调查中进行侵犯。它最近被纳入了由国防高级研究项目机构或DARPA赞助的雄心勃勃的项目,它使用血液中的表观遗传标志物来确定暴露于大规模杀伤武器或其前体化学品。新的生物标志物将用于确保血样的质量,进一步建立这种方法的功率和多功能性。


进一步探索

测定白蛋白的方法有显著差异

更多信息:Joshua W Jeffs等,Delta-S-Cys-白蛋白:一种实验室测试,量化归档的人血浆和血清样品的累积暴露于解冻条件,分子和细胞蛋白质组学(2019)。DOI:10.1074 / MCP.TIR119.001659
引文:更好的样本,更好的科学:新的研究探索研究样本的完整性(2019年9月23日),2021年5月2日从//www.puressens.com/news/2019-09-samples-science-explores-specimens.html检索
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