克罗恩病中发现的耐药鉴定

西奈山医学院的研究人员在研究克罗恩病(Crohn’s disease)患者的10万多个免疫细胞后，发现了一种与克罗恩病有关的细胞特征，这种细胞对治疗无效细胞在八月。发现开辟了识别生物标志物和剪裁患者治疗选择的大门。

该研究分析了从患者小肠组织中取出的炎性和非炎性克罗恩病病变的活检样本。研究人员使用单细胞RNA测序和CyTOF技术，在单细胞水平上实时观察肠道病变，识别肠道病变免疫细胞和循环血细胞以及它们在病变内和周围的相互作用，并绘制出病变内数千个细胞的分布图。

该分析发现，预先识别的精确细胞类型的标志，与患者对克罗恩病的标准治疗的抵抗力相关，抗炎药称为TNF抑制剂。TNF抑制剂是给予中度至严重克罗恩病的患者的主要药剂，但大约40％的患者患有抑制剂的患者最终不响应它或让他们的克罗恩恶化。

“单细胞分析可以转化药物发现，”COMAIN癌症免疫学癌症山脉山山山山，COMENIONING教授的COMAIN教授精密免疫学院主任Miriam Merad，MIRIAM Merad，MD.。TISCH癌症研究所和西奈山人类免疫监测中心主任的癌症免疫学计划。“这真的会让我们更清晰地融入炎症性肠疾病，为什么患者抵制以及我们可以瞄准什么。”

具有签名以识别将在抑制剂上失败的患者有助于避免手术和并发症。根据这项研究的结果，研究人员已经开发出一种临床试验，该试验将在诊断患者时测试是否有可能在患有患者的血液测试中找到签名炎症性肠病。如果是这样，医生可以避免使用TNF抑制剂，而是使用适用于该患者的其他生物学。

“我们设计这项研究的方式是使用免疫学和计算生物学前所未有的精确定义炎症，以更好地了解这种疾病，”共同通讯作者Judy H. Cho医学博士说，她是精确医学高级副院长，查尔斯·布朗夫曼个性化医学研究所主任。伊坎医学院转化遗传学Ward-Coleman教授、医学、遗传学和基因组科学教授。“这些结果强调了当前诊断分析的局限性，以及单细胞绘图工具在识别治疗反应和定制治疗机会的新生物标志物方面的潜力。”

这项研究看了四组患者，并使用单细胞分析一组识别签名。然后，研究人员将数据从单细胞分析中覆盖到多个大型数据集上，这些数据集由其他三组患者组成，其组织已经已知并已知与TNF抑制剂的结果。使用算法和计算生物学，研究人员在多个已知治疗结果的独立小组中证实了从单细胞序列结果中识别出的签名。

“我们的研究表明，将少量患者炎性病变的高分辨率单细胞映射与大规模队列的大规模RNA测序结合起来的方法，具有广泛的临床特征，从而产生可概括的见解，共同通讯作者Ephraim Kenigsberg博士说，他是伊坎数据科学和基因组技术研究所的遗传学和基因组科学助理教授。第一作者Jerome C. Martin博士，医学博士，西奈山伊坎医学院精密免疫研究所博士后，在该研究中也发挥了重要作用。

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