研究人员发现突变,出现在正常细胞随着年龄的增长

细胞分裂是不完美的。随着年龄的增长,基因突变通常出现在在正常细胞。大多数这些突变细胞及其progeny-called“体细胞克隆”——对我们的健康没有影响,但可以帮助一小部分引发肿瘤生长或导致其他疾病如心血管疾病。科学家领导的研究小组从Broad研究所癌症程序和马萨诸塞州总医院(MGH)现在已经创建了一个强大的新方法来检测突变在许多不同类型的正常细胞从正常组织通过分析RNA序列数据。

“这是基因突变的研究首次分析这个景观在正常细胞在许多人体组织说:“克伦Yizhak,博士后和作者科学论文工作。

等研究小组先前检查的突变个体组织类型使用DNA测序。Yizhak和她的同事而不是始于RNA序列数据Genotype-Tissue表达式(GTEx)计划,长期计划由美国国立卫生研究院,收集了大量的数据从许多类型的正常组织捐赠的人死于以外的原因癌症。

“这不是容易识别突变的RNA,因为有很多RNA“噪音”数据,和我们所有的工具已经开发和优化称DNA的突变,“迦得斯坦利说,癌症基因组计算分析小组的主任广泛,病理学和生物信息学主任教授MGH癌症中心和病理学系和这篇论文的主要作者。“克伦发达管道基于我们的DNA分析工具,但分析RNA序列,称为RNA-Mutect,并添加步骤,减少假阳性的数量到一个非常低的水平。”

通过分析RNA序列从29种健康组织488人GTEx数据库,“我们发现,95%的人至少有一个组织有突变,”盖茨说。“这意味着每个人都在这些突变细胞。”

团队公认的几种模式的突变他们发现了与早期的研究一致。例如,调查人员发现,肺、食管、阳光辐射skin-all组织与环境暴露者增加的突变比其他组织(即,更高的“突变负担”)。较高的突变不仅出现在细胞增殖的细胞类型中老年人也很快。

此外,RNA数据显示,正常组织存在包含已知的癌症基因的突变细胞。“我们预计,这些克隆不会成为癌症;他们成长,但可能会停止在某一时刻,”盖茨说。

工作中提出的问题:这样的早期癌症检测突变影响的努力呢?例如一个有前途的血液检测方法称为“血活检”搜索从肿瘤细胞DNA碎片脱落。如果事实证明正常细胞也向血液释放DNA与癌症相关的基因突变,科学家们指出,这可能使这些检测的任务复杂化。

团队的研究到目前为止一直在“宏观”克隆,足够大的生成可读大量的RNA。更普遍的在这个领域的研究中,“看突变在较小的克隆,单身细胞,将会非常有趣,”盖茨说。另一个主要挑战是确定各种疾病的早期事件的进展。为此,美国国家癌症研究所最近推出了一个新的大规模研究的癌前期病变称为癌前期地图集。

“体细胞克隆表达已被证明在其他疾病随着年龄的增加,“男孩旁边继续说。“举个例子,有一个血液中这些克隆和心脏病之间的联系。我们需要研究各种类型的疾病与衰老,增加和测试组件来自体细胞克隆或从其他生物或环境因素。这是一个令人激动的研究方向了解身体年龄的开始。”