高估了突变率

在西非的开始流行,埃博拉病毒并没有改变像人们想象的那样迅速。ETH研究人员解释为什么科学家们低估了它。

科学证据的最后一个主要的埃博拉病毒流行在西非,建议病毒迅速将改变异常可能是由于方法论上的偏见。这是科学家所示由挚友Stadler苏黎世联邦理工学院的教授在巴塞尔生物系统科学与工程系;他们发表了相应的研究PNAS这个星期。

2014年埃博拉发展成为一个流行的时候,一个国际科学家小组估计,病原体的基因组会改变平均每9.5天,基于病毒样本和计算机模拟。这估计是一种非典型的高度变化率。通常,埃博拉病毒的基因组只变异速度不到一半。高突变率导致恐惧,如果病毒迅速改变,它也可以迅速变得更加致命。

然而,在后来的研究中,研究人员评估更大数量的病毒样本无法证实高率。他们表明,在整个流行,病原体只有改变了其典型的速度慢。

ETH的研究人员已经表明高估计变异率的流行是由于当时的有限数量的病毒样本结合使用的计算机模型,计算估计使用基因数据从病毒样本和基本假设。

“小的基因数据可供量模型,更大的底层模型假设的影响最终的结果,”施教授解释了乙。她强调,埃博拉病毒疫情的初步估计基于一个小数据集是深受假设,在回顾已被证明是不准确的。

当前的计算机模型,然而,不简化现实一样使用几年前,他们更深受基本假设,施说。例如,新模型不再认为每个人都有相同的概率传递病原体感染的其他人;相反,他们考虑不同的人口结构。而新模型——其中一些正在开发施组——更加复杂,需要更多的计算,他们提供更准确的结果即使在流行病的开始,当很少基因数据是可用的。新计算的ETH科学家从2014年基因数据显示精度的增加。