科学家绘制世界地图上的抗生素抗性

俄罗斯科学家在世界地图上标出抗生素耐药性
互动世界地图的人类肠道微生物群的潜力,以抵抗抗生素。信贷:生物信息学

俄罗斯科学家创造了一幅互动的人类肠道菌群世界地图,它有可能抵抗抗生素,被称为耐药菌。他们的电阻图谱将有助于确定抗生素使用的国家趋势,并在全球范围内控制抗生素耐药性。

2014年,耐药性问题被世界卫生组织(WHO)列为人类健康的严重威胁之一。“因为我们不采取任何快速和协调措施,减少抗生素的世界正在进入一个时代效率,常见的感染和轻伤后许多年我们学会了成功地对待他们,”福田敬二说,当时的助理总干事健康,安全,以及世界卫生组织的环境。

微生物耐药性是由抗生素在医学和农业上的广泛、不受控制的使用引起的。据预测,到2050年,每年将有约1000万人死于与癌症相关的疾病。来自莫斯科物理与技术学院的俄罗斯科学家创造了一个抵抗地图(来自拉丁词resistance,意为“我抵抗”),一个肠道抵抗体的交互式可视化,也就是所有的集合在人类肠道微生物的基因组中。地理地图导航层是新工具的一个特点,它使研究人员能够陈述关于抗生素耐药性的全球趋势和肠道耐药变异与抗生素使用国家临床指南的相关性的假设。

是什么让微生物群如此特别?

人微生物群,也称为微生物组或微生物群,是指住在人体中的所有微生物的聚集体。与其他器官,组织和生物流体相比,肠道菌群具有最多的细菌。最新研究表明,肠道菌群可以在其对人体健康方面的重要性方面,被视为由多种细菌组成的单独器官,两者都附着在肠壁上并居住在肠腔内。虽然看不见,但这种“器官”重约两公斤,并按照1013(10万亿)微生物细胞。

根据分子遗传学研究,物种的组成在是稳定的,但会因饮食变化而发生剧烈变化。肠道中的微生物群落是一个复杂的生态系统,包含数百种物种,它们的基因组编码的遗传信息是人类基因组的100倍。被称为宏基因组的所有肠道微生物基因组的总和包括一个“行为代码”,它决定了肠道群落内和与宿主之间的营养联系和其他相互作用。人体肠道菌群的稳定或“健康”对于正常的新陈代谢、心血管健康、食物消化和预防传染病至关重要。

在抗生素治疗期间,抗生素抗性基因的丰度增加。当这些基因传递给病原体时,这对个体患者和整个社会都具有可怕的后果。使用偏聚苯甲酰胞质方法的功能组合物分析允许评估抗生素抗性基因的相对丰度从而预测了个体微生物群对耐药性病原体发病的贡献能力。大量的宏基因组已经被发表,这为估计不同人群之间以及不同诊断患者之间的抗性变异提供了机会。

电阻有两个主要的互动工作场:地理图和热图。用户可以选择要在热图上显示的抗生素组或兴趣国,并获得电阻横截面。数据可以由原籍国,性别,年龄和诊断筛选。作者开发的当前版本的交互式地图绘制在数据集上,其中包括来自12项研究的1,600多个,涵盖15个国家。但是,数据集可以通过用户以统一格式的新发布研究结果的其他输入来扩展。

不同的民族特色

通过使用电阻图谱,可以估计对不同抗生素组的耐药性的全球变化,并探索特定药物与临床因素或其他元数据之间的关联。例如,丹麦的肠道宏基因组在欧洲群体中往往表现出最低的耐药性,而法国的样本具有最高的水平,特别是氟喹诺酮类药物,一组广谱抗菌药物。这与以下事实是一致的:在西欧,法国是抗生素使用总量最高的国家,而丹麦和德国在卫生保健和农业方面的抗菌药物使用适中。在光谱的另一端,中国人和俄罗斯人的耐药水平似乎有所增加,这可能是由于宽松的监管政策、频繁的广谱抗生素处方以及无需处方就可获得的非处方抗生素。最低水平的微生物群抵抗观察委内瑞拉土著人口,没有记录接触发达国家的人口。基于电阻图谱的分析揭示了一些新的趋势,有待临床角度的进一步解释。

Konstantin yarygin是可视化工具的创造者之一,“我们预计通过电阻瘤映射启用的全球肠道电阻的探索性分析将提供新的见解,以如何优化医学和农业的使用方式。”

医学专家提供了一些规则,每个使用抗生素的人都应该遵循,以避免在我们与微生物的持续战争中失去阵地。最重要的规则是,抗生素只能按处方剂量服用,不得中断疗程(除非医生推荐)。根据俄罗斯的研究,四分之一的母亲没有完成给孩子开的抗生素治疗疗程。超过规定的病程也同样危险,因为这意味着病原体有更多的时间产生耐药性。因此,要有效地治疗感染,必须服用足够的抗生素,但不能过量。窄谱针对特定类型的细菌是更安全的,应该优先考虑其广谱对等物。在正确识别感染源的前提下,具有靶向作用的药物可降低致病菌存活的可能性。


进一步探索

这是假的,相信抗生素抵抗只是医院的问题 - GP手术也在看到它

更多信息:Konstantin S. Yarygin等人,抵抗鼠标在线可视化人体肠道微生物群抗生素抗性,生物信息学(2017)。DOI:10.1093 / Bioinformatics / BTX134
期刊信息: 生物信息学

引用:科学家绘制世界地图上的抗生素抗性(2017年,5月3日)从HTTPS://MedicalXpress.com/news/2017-05-scists-plot-antibiotic-resistance-world.html
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