研究人员设计了鉴定微生物从母亲传染给婴儿的方法

人们一直认为，母亲在分娩期间和分娩后将肠道微生物传给婴儿，这一过程称为垂直传播，但由于现有技术的限制，这种情况的证据有限。现在，意大利的研究人员已经将实验室技术和新的计算技术结合起来，在一项试点研究中系统地跟踪微生物的垂直传播。

他们的结果，本周发布了mSystems，来自美国微生物学会的开放式访问期刊，发现两者的微生物群落（微生物体）中的几种相同的细菌菌株婴儿和他们的母亲这与在其他婴儿或母亲身上发现的不同，这是垂直传播。此外，发现从母细菌和双歧杆菌种类的透射菌株在母亲和婴儿肠道微生物社区中活跃。

意大利特伦托大学整合生物学中心助理教授、资深研究作者Nicola Segata博士说:“婴儿早期接触微生物对获得和最终发展健康的微生物组很重要。”“我们开发了一些方法来识别微生物从母亲到婴儿的垂直流动，并表明母亲是微生物的来源，可能对婴儿肠道微生物群的发展很重要。”

以前的培养研究已经观察到母亲和婴儿中相同的微生物物种，因此假设发生传播“但实际上，除非您可以看到相同的应变或遗传变体，否则很难得出结论，”Co-Senual说作者Adrian Tett，博士，一名高级研究与中心助理。虽然使用耗时的培养方法，一些微生物遵循母亲对婴儿，但是我们证明可以在不使用栽培的情况下推断出垂直传输，并将以更大的规模跟进。“

Segata说，科学家们是否在婴儿肠道中殖民殖民地进行争论。如果发现有权证据表明，在分娩前或分娩期间可能会传播一个特定的微生物，这可能会对婴儿的未来健康有害，但是，在怀孕并提供一些预防治疗的同时可以测试母亲。例如，目前的实践试验孕妇B组链球菌，可导致婴儿感染;如果女性测试阳性，请在交付前立即进行药物以防止微生物传递给婴儿。

当婴儿三个月大的时候，Segata和同事收集了由当地医院招募的五个母婴对的粪便和母乳样本。当婴儿10个月大时，他们再次收集来自两对母婴对的其他样本，当婴儿16个月大的另一个母亲对时，来自另一个母亲对。他们将一个叫做霰弹枪偏测量测序的实验室技术施用至24个微生物组样品（八个母粪样本，八个婴儿粪便样品和八个母乳样品），以查看哪些微生物存在。他们使用来自两对粪便样本中称为MetaTranscriptomics的额外工具，以查看哪些微生物活性。

最初，正如预期的那样，母亲的肠道比婴儿的肠道有更大的微生物多样性。然而，16个月大的婴儿的肠道微生物群已转向更像母亲的组成，微生物多样性增加。出生后不久，母乳样本的多样性有限;在婴儿的肠道微生物群中，皮肤微生物的数量很少，这表明皮肤微生物不会在人体肠道中繁殖。

为了分析从母亲到婴儿的微生物传播，该团队进一步分析了更精细的宏基因组样本，使用新开发的计算方法来评估特定的菌株。一名婴儿携带的普通双歧杆菌菌株与他母亲的菌株99.96%相同，但与其他婴儿和母亲的双歧杆菌菌株明显不同，这为微生物垂直传播提供了强有力的证据。另一个婴儿则携带另外两种细菌的菌株，即Coprococcus comes和Ruminococcus bromii，这两种细菌99%以上与他母亲的相同。通过元转录组学，研究人员在母亲和婴儿的肠道中观察到一些相同的细菌菌株。

虽然结果仍然很早，Segata说：“婴儿可能是来自母亲的婴儿的大部分细菌。”在持续的工作中，调查人员正在从婴儿出生时间到超过一年的年龄，包括来自几个身体位置的母亲和婴儿的微生物分析的更多母亲对。它们将在出生后不久的情况下比较阴道和剖宫产段的微生物传输路线，母乳喂养和皮肤到皮肤接触。

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