预测结核病药物遗传抗性的新在线工具

肺结核
这张显微照片显示结核分枝杆菌使用抗酸Ziehl-Neelsen染色;抗酸染色取决于分枝杆菌在用无机酸或酸-酒精溶液处理时保留染料的能力,如Ziehl-Neelsen或Kinyoun染色,这是针对结核分枝杆菌的碳紫红素方法。信贷:公共领域

了解可用于治疗患有结核病(TB)的药物可以在几天或几周内加速药物,这归功于新的免费在线工具。

新TB-Profiler该研究由伦敦卫生与热带医学学院Taane Clark博士领导的科学家团队开发。该研究分析并解释了基因组序列数据,以预测用于治疗结核病的11种药物的耐药性。这种快速工具只需要几分钟,这意味着序列数据现在可以毫不延迟地使用。重要的是,它还消除了对专业生物信息学技能的依赖,而这些技能在临床环境中并不容易获得。有关该工具工作原理的数据发表在开放获取期刊上基因组医学

加速过程在用耐药结核病治疗患者时找到适当的药物,提高了治愈的可能性。通过毫不拖延地选择要选择的最佳治疗过程,发现因阻力无效可不予理会,缓解有害的,不愉快的,通常是持久的副作用。

研究人员说,结核病检测工具可以在tbdr.lshtm.ac.uk-将有助于控制耐药结核病,目前耐药结核病的出现有可能破坏全球控制该疾病的努力。世界卫生组织估计,全球1100万结核病例中有5%患有耐多药结核(MDR-TB), 2013年出现了大约48万新的耐多药结核病例,21万人死亡。

TB-Profiler是使用全球数据开发的,并引用了1325个突变的文库结核分枝杆菌(导致结核病的细菌),使该工具成为迄今最全面和最准确的数据来源。

Taane Clark博士是遗传流行病学和统计基因组学的读者,他说:“测序已经帮助病人管理一些疾病,如艾滋病,但现在测序是可能的结核分枝杆菌来自疑似多药耐药患者的痰液意味着它在管理中有一定作用。我们已经开发了一个原型来指导耐药性疾病患者的治疗,个性化的药物和治疗可以提高治愈率。”

传统的基于实验室的耐药性测定方法包括培养细菌,看它是否能在药物作用下存活,这一过程可能需要数周,有时需要数月,并且需要严格的安全措施来保护实验室人员。

这组科学家强调,他们的研究显示了全基因组测序在提高耐药性分子检测的准确性、提高敏感性和特异性方面的潜力。该工具还提供了关于细菌基因型的数据,可用于流行病学研究和公共卫生专家追踪疾病传播链。

结核病预警的共同作者Ruth McNerney博士补充说:“这是我们对抗耐药性斗争中值得欢迎的一步。现在是时候将测序从研究实验室带入临床了。患者耐药的疾病必须忍受用有毒药物治疗的许多个月,没有成功的保证。个性化治疗将增加他们的生存机会,同时将可怕的副作用降到最低。”


进一步探索

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更多信息:Francesc Coll, Ruth McNerney, Mark D Preston, José Afonso Guerra-Assunção, Andrew Warry, Grant Hill-Cawthorne, Kim Mallard, Mridul Nair, Anabela Miranda, Adriana Alves, João Perdigão, Miguel Viveiros, Isabel Portugal, Zahra Hasan, Rumina Hasan, Judith R Glynn, Nigel Martin, Arnab Pain, Taane G Clark。全基因组序列抗结核耐药性的快速测定。基因组医学DOI: 10.1186 / s13073 - 015 - 0164 - 0
期刊信息: 基因组医学

引用:预测结核病药物遗传耐药性的新在线工具(2015年5月27日),2021年5月2日从//www.puressens.com/news/2015-05-online-tool-genetic-resistance-tuberculosis.html检索
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