浅析科学中发表的人蛋白地图集
今天发表的研究文章科学呈现基于人蛋白质地图集的第一个主要分析,包括与癌症相关的蛋白质的详细情况,血液中存在的蛋白质数量以及市场上所有批准的药物的目标。
由克努特和爱丽丝·瓦伦堡基金会支持的大型跨国研究项目“人类蛋白质图谱”最近(2014年11月6日)启动了一个开源项目组织- 基于互动地图人类蛋白质。该数据库基于1300万张带注释的图像,绘制出了人体所有主要组织和器官中蛋白质的分布图,显示了仅限于特定组织(如大脑、心脏或肝脏)的蛋白质和所有存在的蛋白质。作为一种开放获取资源,它有望帮助推动新的诊断和药物的开发,但也将提供正常人类生物学的基本见解。
在科学在一篇题为《基于组织的人类蛋白质组图谱》(Tissue-based Atlas of the Human Proteome)的文章中,该文章的第一作者Mathias Uhlén表示,通过结合基因组学、转录组学、蛋白质组学和基于抗体的分析,已经分析和分类了人类大约20,000个蛋白质编码基因。斯德哥尔摩皇家理工学院微生物学教授,人类蛋白质图谱项目主任。
分析表明,几乎一半的蛋白质编码基因以一种普遍的方式表达,因此在所有分析的组织中都存在。
大约15%的基因显示在一个或多个组织或器官中富集的表达,包括众所周知的组织特异性蛋白质,例如胰岛素和肌钙蛋白。睾丸或睾丸具有最多的组织富集的蛋白质,然后是脑和肝脏。
分析表明,从细胞分泌约3,000个蛋白质,另外的5,500蛋白位于细胞的膜系统中。
“这对制药行业来说是重要的信息。我们表明,目前批准的药物70%的靶点是分泌或膜结合蛋白,”Uhlén说。“有趣的是,其中30%蛋白质在所有分析的组织和器官中都能找到目标。这可能有助于解释药物的一些副作用,从而可能对未来的药物开发产生影响。”
该分析还包括对发生在人体不同部位的代谢反应的研究。最特化的器官是肝脏,它有大量的化学反应,在肝脏的其他部位没有发现人体。
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