人类蛋白质地图集将有助于确定疾病

瑞典的研究人员是编译一个了不起的“阿特拉斯”,明确了成千上万个人的位置蛋白质在体内的组织和细胞的功能将给科学家重要见解不同的蛋白质以及蛋白质的分布的变化可以反映在癌症等疾病。斯德哥尔摩皇家理工学院的Mathias Uhlén教授领导了这个项目,他说:“我们正在试图绘制生命的组成部分。”

该项目非常雄心勃勃,依赖于成千上万蛋白的选择性鉴定和映射,其中许多功能尚不清楚,并且需要开发大量基础设施,以使蛋白质能够在现实的时间内识别。

10月1日至4日,uhlén在奥地利因斯布鲁克的第三个功能基因组学会中描述了欧洲科学基金会的第三个功能基因组学会的人类蛋白质地图集。功能基因组学描述了基因及其产品,蛋白质,在活细胞中复杂网络中相互作用的方式。如果这些相互作用异常,可能会导致疾病。Innsbruck会议从欧洲汇集了450多名科学家,讨论了近期功能基因组学在疾病中的作用。

蛋白质阿特拉斯团队首先使用人类基因组 - 人体细胞中所有20000左右的基因的序列 - 以编码单个蛋白质。然后,它们开发“抗体” - 鉴定特定靶标的蛋白质分子 - 抵抗每个蛋白质。然后用标记物标记识别给定蛋白质的抗体,以使其在显微镜下可见,并且暴露于不同组织和细胞的样品。抗体与蛋白质结合,以这种方式可以检测蛋白质的位置。

“为了做这件系统地需要大量的自动化和机器人,”Uhlén说。“我们有六个软件工程师写作代码只是为了跟踪样本。该项目每天都会产生400千兆字节的数据。”在该项目上有一个100强大的团队,由于韩国和中国的抗体制作景点,有一个100强大的项目。

“为了了解我们已经取得的进展,我们在第一年生产了抗体,”Uhlén说。“今年我们希望能生产3000辆。”该计划于2003年启动,Uhlén相信,如果有足够的资金,第一个完整版本的地图集将在2014年问世。

到目前为止,该团队已经绘制出了人类细胞和组织中大约5000种蛋白质的位置图。研究人员还在调查某些常见癌症——结肠癌、前列腺癌、肺癌和乳腺癌——是否与正常组织有不同的蛋白质谱。通过这种方式,可以识别出新的“生物标记”——表明组织或细胞处于患病状态的分子,这可以在疾病的早期阶段向医生发出警报。

资料来源:欧洲科学基金会


进一步探索

羊驼纳米体可能是对抗COVID-19的强大武器

引用:人类蛋白质阿特拉斯将有助于查明疾病(2008年10月17日)从https://medicallexpress.com/news/2008-10-human-protein-atlas-disease.html
此文件受版权保护。除作私人学习或研究之公平交易外,未经书面许可,任何部分不得转载。本内容仅供参考之用。
股票

反馈到编辑

用户评论