靶向下一代测序显示在晚期恶性肿瘤中有大量的基因组突变

恶性胸膜间皮瘤(MPM)肿瘤的下一代测序显示了一个复杂的突变设置，涉及DNA修复、细胞存活和细胞增殖途径的基因中有大量的基因改变。增加的突变积累与肿瘤的早期进展和降低生存率相关。

MPM是一种致命的癌症石棉曝光它是在肺部的外层形成的。3年生存率只有8%，大多数MPM患者诊断为晚期疾病，治疗选择有限。新一代测序(NGS)是一种确定从细胞中分离的基因组DNA分子中核苷酸的身份和顺序的强大方法，靶向的NGS专注于特定的一组基因，而不是测序整个基因组。NGS的使用有可能准确描述地物的类型、位置和数量基因突变在MPM中，允许与患者特征的关联，包括生存数据。

来自奥巴塞诺，意大利大学的研究人员，意大利和圣安东尼奥和比亚加西亚，阿尔森里亚，意大利使用靶向NGS在123例先进（III和IV和IV）MPM和完整的临床信息中的123名患者中回顾52基因。在从福尔马林固定的石蜡包埋（FFPE）肿瘤组织中分离的基因组DNA上进行测序。Sanger测序用于验证NGS结果，使用免疫组织化学来检查两种基因的蛋白质表达。

发表于胸肿瘤学杂志国际肺癌研究协会(IASLC)的官方杂志显示，这些突变集中在两个主要途径上，即p53/DNA修复和PI3K-AKT。PIK3CA、STK11或TP53基因中的某些突变与疾病进展时间减少相关。此外，当多重突变积累时，疾病进展的时间和总生存率都降低。最后，BAP1基因的基因组突变导致BAP1蛋白内氨基酸的变化，与BAP1蛋白的核定位相关。

“我们的结果表明，尽管从FFPE肿瘤组织中分离出的碎片化和低产量基因组DNA面临着众所周知的挑战，但NGS显然是可行的，”作者说。“我们的数据没有确定任何特定突变作为单一驱动基因，如在肺腺癌中发现的，但我们的数据表明，在MPM中有几个非驱动突变的积累，这可能解释了这种与石棉有关的疾病的极长潜伏期。”对于未来，作者建议“一些突变将进一步评估功能变化，可以仔细考虑为未来临床试验调查靶向治疗在MPM中的作用的分层因子。

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