出生缺陷的第一个蛋白质组学分析表明了一种新技术的力量

稀有的动物模型的第一个蛋白质组学分析，有时致命的出生缺损，史密斯-LEMLI-OPITZ综合征（SLOS）揭示了导致它比以前理解更复杂的分子机制。SLO涉及多种神经感觉和认知异常，精神和身体残疾，包括影响视觉和严重病例的人，死亡前10岁。

布法罗大学的科学家于8月26日发表了这项研究分子和细胞蛋白质组学，首先是展示乳膏大鼠模型视网膜中的广泛蛋白质的变化。为了学习SLO，UB研究人员集中在视网膜上，这是经历的逐步退化由于sslos。他们比较蛋白表达对正常大鼠视网膜的影响

这篇论文的资深作者、Meyer H. Riwchun教授Steven J. Fliesler博士解释说，自20世纪90年代以来，当人们发现sslos涉及有缺陷的胆固醇生物合成时，很多关于该疾病的研究倾向于只强调胆固醇代谢。乌兰巴托大学眼科学系副主席兼研究主任，纽约西部退伍军人事务部医疗保健系统的研究卫生科学家。

“在文献中只有少数报道地址患有这种疾病的人们的细胞和组织的非脂质成分，”他说。“我们有一些线索，有变化基因表达在SLOS和由于蛋白质的基因代码，而不是脂质，我们认为也许有显着的蛋白质组学变化。

“这是第一次有人看蛋白质变化在这个疾病模型我们发现了成百上千个，”同时也是生物化学教授的弗雷斯勒继续说道。虽然有这种疾病的基因老鼠模型，但它们的效用有限，因为它们只能存活一天，而啮齿类动物的视网膜(弗利斯勒主要感兴趣的领域)在出生后大约一个月形成并完全成熟。

“我们使用的ssls老鼠模型能够存活至少三个月，在此期间视网膜经历进行性退化，”弗利斯勒说。他补充说，虽然sls动物模型中的视网膜会退化，但尚不清楚人类的视网膜最初是否经历了正常的发育，然后在疾病过程中发生退化。

UB研究还提供了第一次瞥见在这种动物模型中的视网膜模型中的细胞如何，该观察由共同作者Matthew Behringer提供，他们将该研究作为医学院生物化学系的UB本科生和生物医学科学。

“通过蛋白质组学分析，我们发现感光细胞(杆状细胞和锥状细胞)不是通过传统的程序性细胞死亡(或凋亡)，而是通过一些替代机制死亡，这仍在研究中，”Fliesler解释说。

探索SLOS鼠模型的蛋白质组学,乌兰巴托的研究人员,由共同通讯作者瞿小君,博士,副教授在乌兰巴托制药科学系的药学和制药科学学院和美国眼科,使用基于离子电流的蛋白质组学分析,一种研究蛋白质的相对较新的和复杂的方法。

“这篇论文表明基于离子电流的蛋白质组学分析优于传统方法，可以广泛应用于更常见的疾病，如糖尿病、心血管疾病、阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性，”Fliesler说。

蛋白质组学分析是一种研究蛋白质表达差异的方法。Qu的实验室是大规模蛋白质组学成员的国家领导人之一。他和同事的复杂方法已经发展是这项研究成功的关键因素。该技术为许多蛋白质提供了比常规技术的覆盖率，特别是对于许多膜相关视网膜蛋白。

Qu在这种独特的方法上的工作消除了传统蛋白质组学分析中可能发生的假阳性的主要来源。离子电流基于蛋白质组学分析的额外优点是它需要极小的材料，只需100微克，并且是目标，定量和高度可重复的。该方法是为各种各样的生物标本开发的，从微生物到人类。

该研究举例说明了纽约眼学院州立大学的两个实验室之间的成功合作，由Suny Reach倡议提供了一个阳光广泛的联盟，它汇集了四个Suny医学院的眼科部门的研究人员，包括UB，以及Suny验光学院和纳米级科学技术学院。

“感谢SUNY眼科研究所和SUNY REACH，我们有一个蛋白质组学核心模块，我们促进整个SUNY眼科研究所的合作，使用这种方法，”Fliesler解释说。“这有助于我们在纽约州立大学内部以一种成本效益非常高的方式进行这种分析，而不必向其他机构或私人公司支付此类分析费用。”

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