来自囊性纤维化患者的DNA,没有慢性感染指向未缺点的突变
(欧宝娱乐地址Medical Xpress)——比较健康状况最好和最糟糕的患者的DNA,可以揭示耐药性和易感基因。该方法在最容易发生早期慢性气道感染的囊性纤维化患者中发现了罕见的DCTN4基因变异。
DCTN4基因编码dynactin 4。这种蛋白质是分子马达的一个组成部分,分子马达通过细胞传送带将麻烦的微生物运送到微小的化学容器中溶酶体毁灭。
这项研究由华盛顿大学领导,是美国国家心肺血液研究所GO外显子组测序项目和肺GO项目的一部分,这两项主要的国家卫生研究所慢性病研究工作。
类似于“测试极端”策略可能在揭示中具有重要应用遗传因素在其他更常见的特征之后,比如健康和不健康的心脏。
囊性纤维化感染易感性研究的结果出现在7月8日,举行自然遗传学。
有问题的感染是假单胞菌铜绿假单胞菌,一个机会主义土壤细菌这通常会感染囊性纤维化和其他气道阻塞疾病患者的肺部。这些细菌可以结合成一种光滑的,难以治疗的生物膜妨碍呼吸和伤害肺组织。慢性感染与肺功能差和更短的生活有关囊性纤维化患者。这些细菌很少攻击肺部正常、免疫系统功能良好的人。
在研究中,DCTN4的这些罕见变化没有出现在任何囊肿中纤维化患者谁是对假单胞菌感染最抗性的。研究对象最容易发生早期,慢性感染至少有一个DCTN4畸形变种。密码变异产生可能无法正常工作的蛋白质。
该报告的牵头作者于自然界中发表了7月8日遗传学,是华盛顿大学公共卫生学院的生物统计学研究副教授玛丽J.乔迁。高级作者是医学遗传学家Michael Bamshad,遗传医学分部儿科教授。ob体育开户网址
在他们的知识的程度上,研究人员认为,这可能是第一次通过在疾病谱的每个极端测序人们的所有蛋白质编码部分来发现复杂性状的遗传变异。
“当我们完成这项研究时,我们没有考虑候选基因,”乔尔德说。91例患者DNA的统计分析带领研究团队给这种特定基因。在初步的研究组中,43名儿童首次发病了慢性肺部感染与假单胞组织,因为它们很年轻,而48名最古老的人尚未达到慢性感染状态。选择测序的患者来自于早期的假单胞菌对照(EPIC)观察研究,在西雅图儿童研究所和北美的项目囊性纤维化遗传修饰词的研究。外显子组测序是由华盛顿大学的研究人员在华盛顿大学基因组科学教授Deborah Nickerson的实验室完成的。
研究受试者DNA的蛋白质编码部分的比较称为研究人员注意DCTN4基因的畸形变化。研究人员继续筛选一个选定的1,322名其他史诗参与者来检查他们的发现。
外显子组测序项目(Exome Sequencing Project)的科学家们正在使用一种类似于这项研究的方法,来检查对其他慢性疾病(如肥胖、心脏病发作和高血压)的抗性和易感背后的基因。他们研究与心脏病相关的基因变异,例如,将胆固醇水平理想的人的DNA图谱与胆固醇水平异常低的人的DNA图谱进行对比。
研究人员指出,采用类似的策略来确定其他复杂人类特征的遗传学基础可能需要更大样本量的外显子组测序。
“随着exome测序的成本迅速下降,更有效的统计分析变得可用,我们认为医学研究人员对这种方法的热情将继续,”BAMSHAD预测。ob欧宝直播nba
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