抗生素对真菌菌群的影响因人而异

抗生素对真菌菌群的影响因人而异
22例健康人2周内真菌菌群特征的动态变化。(A) 22名健康受试者在间隔1周时间点的真菌种类相对丰度。对于每个受试者,barplot按时间排序(- D15, - D7, - D1在使用抗生素之前)。所代表的物种在研究对象中达到了平均相对丰度在1%以上。(B) Alpha多样性:22名健康受试者在间隔1周时间点的otu数量和Shannon指数值的小提琴图。(C) Beta多样性:ITS1测序数据中,不同受试者(受试者之间)捐赠的样本之间和相同受试者(受试者内部)捐赠的样本之间的布雷-柯蒂斯不相似值。取值范围为0到1,其中0表示差异最小,1表示差异最大。(D) 22名健康受试者白色念珠菌DNA在间隔1周时间点的小提琴图和箱线图。每个点代表一个样本。对于所有面板,上部晶须从铰链处延伸至1.5×四分位区间以下的最大值,下部晶须从铰链处延伸至1.5×四分位区间以上的最小值。 Credit:mBio(2022)。DOI: 10.1128 / mbio.02880-22

抗生素治疗会破坏人体肠道中有益和有害细菌的平衡。这种破坏可能导致肠道菌群中真菌物种的过度生长,包括常见的肠道酵母白色念珠菌。然而,研究人员对其潜在机制的了解有限。

本周mBio,这是第一次进行类似的研究在美国,欧洲的研究人员报告了使用一种常见的-内酰胺类抗生素治疗如何导致C。在病人。值得注意的是,他们发现并非所有患者的反应都是一样的,白色念珠菌数量增加的程度在很大程度上取决于个体的菌群。这种变异表明白色念珠菌的风险过度生长,以响应,对每个人来说都不一样。

法国巴黎巴斯德研究所的微生物学家、资深作者Marie-Elisabeth Bougnoux医学博士说:“这项研究表明,情况比以前想象的要复杂得多,使用某些抗生素,如-内酰胺,白色念珠菌的增加因人而异。”

研究人员长期以来一直在研究抗生素对但对真菌菌群或肠道集合的关注较少.这项新研究的作者指出了两个原因。

“首先,真菌菌群很难用宏基因组学技术来研究,”该研究所的博士生、论文第一作者玛戈特·德拉维(Margot Delavy)说,“其次,真菌的浓度比细菌的浓度低得多,”这使得它们更难测量。她说:“研究肠道真菌的可重复宏基因组技术直到最近才出现。”

在这项新研究中,Bougnoux和她的同事使用了观察两组11例健康患者在使用头孢噻肟(一组)和头孢曲松(一组)治疗前、治疗中和治疗后肠道菌群的变化。这两种药物都是第三代头孢菌素类抗生素。

该小组首先确定了粪便DNA中与真菌物种相关的部分。然后,在接受抗生素治疗之前,他们使用高通量测序来确定志愿者健康肠道中存在的真菌种类。他们发现,物种的多样性和丰富度不仅因人而异,而且在同一个体中也会从一个集合到另一个集合。该团队使用特定的qPCR来量化白色念珠菌的水平,发现这种真菌存在于95%的参与者中。

研究人员在抗生素治疗期间和治疗后进行了类似的分析。他们发现,在接受抗生素治疗后,所有患者的真菌负荷——粪便dna的比例——都有所增加。但在物种层面上,这些反应差别很大。一些个体经历了白色念珠菌和其他物种数量的显著增加,而另一些个体则没有。(至少有一名参与者甚至表现出了下降。)

对样本的进一步分析显示,真菌对抗生素治疗的反应变化与β -内酰胺酶的活性有关,β -内酰胺酶是由受试者菌群中的内源性细菌产生的。体内-内酰胺酶水平较低的人比体内-内酰胺酶水平较高的人有更多的真菌生长,包括白色念珠菌。

Bougnoux之前的工作重点是研究肠道白色念珠菌的定植如何导致感染,他说该小组希望把重点放在因为这是殖民化的主要风险因素。她指出,这项新研究是了解真菌菌群对治疗反应的有希望的第一步,但这只是开始。

Bougnoux说:“我们的研究是在只接受一种抗生素的人类志愿者身上进行的,但实际的患者往往会接受几种抗生素。”她补充说,那些感染最多的人最有可能患上真菌感染。“我们发现的β -内酰胺和肠道白色念珠菌定植减少之间的关系是否也适用于这些患者,还有待观察。”

更多信息:Margot Delavy等人,一项临床研究提供了第一个直接证据,表明粪便β-内酰胺酶活性的个体间变化影响肠道真菌菌群动态响应β-内酰胺抗生素,mBio(2022)。DOI: 10.1128 / mbio.02880-22
期刊信息: mBio

引用:抗生素对真菌菌群的影响因人而异(2022年,11月30日),检索自2022年12月5日//www.puressens.com/news/2022-11-antibiotics-effect-mycobiome-vary-person.html
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