一种快速、高灵敏度测定废水中SARS-CoV-2的方法

一种快速、高灵敏度测定废水中SARS-CoV-2的方法
图形抽象。信贷:全环境科学“,(2022)。DOI: 10.1016 / j.scitotenv.2022.157101

基于废水的流行病学(WBE)已被证明是了解SARS-CoV-2在社区传播的一种极好的手段。它现在被用于世界各地的多个地区,以跟踪病毒的流行情况,作为确定COVID-19状态的代理。尤其重要的是,WBE可用于估计COVID-19的流行情况,包括无症状病例。然而,WBE检测SARS-CoV-2的一个主要缺点是传统方法不太灵敏,不能可靠地检测到低病毒载量。

来自北海道大学和盐野木株式会社的科学家团队开发了一种简单、快速、高灵敏度的方法,用于检测废水中SARS-CoV-2。该方法名为EPISENS-S,不需要专门的设备全环境科学“,

在2019冠状病毒病大流行期间,日本的人均病例数最低。因此,病毒大量涌入已经建立的WBE方法也较低,而且由于它们的灵敏度低,很难进行评估。研究团队之前的工作表明SARS-CoV-2病毒与污水中的固体有关因此,他们专注于开发一种分析废水固相的方法。

他们开发的EPISENS-S方法包括离心收集分离样品中的所有固体。然后用一种市面上可以买到的工具包对这些固体进行处理,以提取所有的RNA;然后RNA被逆转录和扩增,以获得大量的DNA副本。另一组样品被用然后是RNA提取和逆转录合成DNA:这种方法目前在日本广泛应用。从这些方法中获得的DNA进行定量PCR (qPCR)。

一种快速、高灵敏度测定废水中SARS-CoV-2的方法
EPISENS-S方法比聚乙二醇法(PEG-qPCR)灵敏度高100倍(两个数量级),聚乙二醇法是日本最常用的方法(Hiroki Ando, et al.)。全环境科学“,”2022年8月8日)。图片来源:Hiroki Ando et al,全环境科学“,2022年8月8日

研究小组发现EPISENS-S方法的灵敏度大约是聚乙二醇方法的100倍。他们使用EPISENS-S对来自两个国家的废水进行了长期分析并发现收集的样本中RNA浓度的变化与该城市报告的病例数量的变化具有高度相关性。EPISENS-S还可以检测和定量辣椒轻度斑驳病毒(PMMoV),该病毒与辣椒轻度斑驳病毒有关并被用作内部控制。

EPISENS-S提供了一种跟踪无症状以及未被临床证实的COVID-19病例的方法。此外,随着接种率的提高,它有很大的潜力继续跟踪SARS-CoV-2的流行。最后,EPISENS-S还可以用于跟踪其他感染人数和病毒载量较低的病毒性疾病。


进一步探索

废水病毒载量可提供COVID-19暴发的预警

更多信息:Hiroki Ando等,高效实用的增强固体灵敏度病毒识别系统(EPISENS-S):一种用于日常废水监测的快速、低成本的SARS-CoV-2 RNA检测方法,全环境科学“,(2022)。DOI: 10.1016 / j.scitotenv.2022.157101
期刊信息: 全环境科学“,

所提供的北海道大学
引用:一种用于测定废水中SARS-CoV-2的快速、高灵敏度方法(2022年,9月29日),检索自2022年10月21日//www.puressens.com/news/2022-09-rapid-highly-sensitive-method-sars-cov-.html
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