研究人员发现了影响免疫细胞功能的基因变异

图1 pu1转录因子qtl特性来自:中性粒细胞增强子pu1结合和染色质环的遗传扰动与自身免疫性疾病相关信贷:自然通讯(2021)。DOI: 10.1038 / s41467 - 021 - 22548 - 8

研究人员将免疫细胞的全基因组测序和功能图谱结合起来,以更多地了解基因变异对疾病的影响。

某些基因变异导致修饰蛋白结合,也可以在一些高危人群中看到一项新的研究发现。

威康桑格研究所的科学家们,约瑟卡雷拉斯白血病研究所在西班牙,和MRC伦敦医学科学研究所(LMS)发现,某些基因变异,这改变蛋白的结合能力PU.1在中性粒细胞,也发现与汽车有关免疫疾病易感性。

这项新研究发表在自然通讯(2021年4月16日)。BLUEPRINT揭示了血液中的变异“性格和数量会影响一个人患上复杂疾病的风险,比如心脏病,以及风湿性关节炎、哮喘、腹腔疾病和1型糖尿病等自身免疫性疾病。”

这项新的研究提供了更多关于pu1和中性粒细胞是如何受到影响的机制细节并为研究人员提供了一个候选基因列表,这些基因将成为进一步研究的兴趣所在,以研究这些基因是否对自身免疫疾病的发展有因果影响。

个体之间的差异,如疾病风险,可以受到许多因素的影响。虽然其中一些变异受到环境和饮食等外部因素的影响,但有相当一部分是由遗传驱动的。然而,大多数变异不是通过单个基因的功能驱动的,而是通过控制基因活动的基因或区域的许多微妙变化的总和。

此前,BLUPERINT进行了大规模的全基因组关联研究(GWAS),以调查哪些基因差异与血细胞变化有关,以及这些变化是否与疾病有关。GWAS是识别与人类变异和疾病相关的基因组区域的强大工具。然而,GWAS并不研究特定的细胞类型,这使得很难确定特定区域编码的基因和它们调控的细胞类型。

在这项新的研究中,来自威康基金会桑格研究所的科学家,约瑟卡雷拉斯白血病研究所,西班牙,和MRC伦敦医学科学研究所(LMS),结合以前的GWAS数据与中性粒细胞−深入功能分析的一种免疫细胞,在体内白细胞的80%。

他们发现,与自身免疫性疾病风险增加相关的基因变异也对中性粒细胞中特定蛋白质的结合产生影响,这种蛋白质被称为pu1。一些遗传变异使pu1不能与中性粒细胞DNA结合,这导致了随后的基因表达和中性粒细胞行为的改变。

虽然还需要进一步的研究来确定pu1结合能力的这种变化是否会直接导致某些自身免疫疾病,但这项研究进一步了解了这些基因变异对体内细胞的影响。除此之外,研究人员还提出了一个候选名单这可能会为自体免疫的遗传原因提供更多的信息

更多信息:Stephen Watt等人。中性粒细胞增强子pu1结合和染色质环的遗传扰动与自身免疫性疾病相关,自然通讯(2021)。DOI: 10.1038 / s41467 - 021 - 22548 - 8

期刊信息:自然通讯