“友好”的细菌可能会影响COVID严重性

美国疾病控制和预防中心(CDC)授予范德比尔特大学医学中心的为期两年,价值3.7美元的合同,以确定基因和细菌因素可能会增加从COVID-19严重疾病和死亡的风险。

“multi-omic”调查将决定COVID-19疾病的严重程度可能会影响到病人的基因组成和细菌生活在他们的航空公司,他们的“呼吸道微生物。”

在上个月发表的一篇论文中,VUMC人员报道,COVID-19病毒,SARS-CoV-2,与呼吸道细菌相互作用的方式可能会加重症状。

cdc资助项目也将基因型,或确定的基因序列,SARS-CoV-2隔绝鼻拭子收集从5000年感染病人VUMC确定任何COVID-19变体的存在。

研究人员希望通过了解这些相互作用的因素,他们将能够预测哪些患者可能会患重病或没有回应抗病毒治疗包括抗体疗法。最终目标是改善诊断转化为更有效的治疗和更好的结果。

VUMC唯一能够做这种调查,因为其资源的深度在基因组学、病毒学和传染病,Suman Das说,医学博士,副教授。

Das和乔纳森•施密茨医学博士,医学分子传染病实验室的主任,正在进行项目的首席调查员。黑带大师西蒙•Mallal科学主任优势(VUMC技术先进的基因组学)和IMGSCT (Immunogenomics、微生物遗传学和单细胞技术)的核心,是共同的。

关键资源包括BioVU VUMC大规模生物400000多个人的DNA和其它生物材料样品。

BioVU与“合成衍生物,”电子健康记录被剥夺了识别信息,使研究人员研究的差异具体包括COVID-19患者的基因组成。

另一个资源是MicroVU,包含超过200种不同种类的生物信息库标本细菌VUMC有关研究数据仓库。施密茨组合和玛丽亚Hadjifrangiskou博士和管理由范德比尔特临床研究所(VICTR),资源包括呼吸道标本COVID-19病人。

有利的病毒基因组的核心将进行高通量测序确定变异的存在,和IMGSCT核心HLA和其他immunogenomics打字,Mallal说。

达斯和他的同事们,包括基督教Rosas-Salazar医学博士,英里,呼吸道病毒和微生物之间的相互作用研究好几年了。

2018年,他们报道,婴儿有较高的“友好”的细菌乳酸菌出现在他们的鼻子或喉咙的上部急性呼吸道合胞病毒(RSV)感染期间不太可能发展儿童喘息。

这项研究发表在变态反应与临床免疫学杂志》上,研究人员报道,SARS-CoV-2感染和病毒载量,多少病毒存在,影响呼吸道中的多个细菌的丰度。

“这些细菌可能是重要的调制你如何应对病毒本身,“Rosas-Salazar说,儿科助理教授,论文的第一作者。ob体育开户网址“我们知道很少在COVID-19风险因素的结果,因此了解这些viral-bacterial交互可能预测严重程度的关键。”

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