B.1.1.7在美国迅速传播的COVID-19变种

在此地图上,从爆发.Info,较暗的颜色显示SARS-COV-2变体的水平增加,B.1.1.7在各种状态下。信誉:Scripps研究所

的faster-spreading B.1.1.7变体SARS-CoV-2第一次发现在英国,导致COVID-19的冠状病毒,很快地成为占主导地位的变种的病毒在美国,据一项研究来自斯克里普斯研究所的科学家和COVID-19测试机螺旋。

研究结果发表在今天的细胞,建议未来Covid-19案例编号和在美国将高于另有规定的。该分析表明,在越来越多的SARS-COV-2样品中可检测到的变体比先前显着的SARS-COV-2谱系更传播40-50%。其他研究发现证据表明,B.1.1.7变体可能会导致致命的Covid-19的可能性约为50%。

“B.1.1.7在去年年末出现后迅速成为英国和其他国家SARS-CoV-2的主要变种,美国现在也处于类似的轨道上,”该研究的共同高级作者克里斯蒂安·安德森博士说,斯克里普斯研究中心免疫与微生物系教授、斯克里普斯研究转化研究所传染病基因组学主任。“我们需要立即采取果断行动,将COVID-19的发病率和死亡率降至最低。”

除Andersen外,另一位资深作者是William Lee博士,他是Helix的科学副总裁,该公司为美国各地的组织提供基于pcr的COVID-19检测。这项研究也由尼科尔·华盛顿博士(Helix研究副主任)和安德森实验室的卡蒂克·甘瓦拉普(Karthik Gangavarapu)撰写。

李博士说:“B.1.1.7的感染率是一周多一点的两倍,传播率增加了40- 50%,这意味着它可能对公共卫生产生重大影响。”“我们继续监测这种病毒和其他新出现的病毒变种的传播是至关重要的,但我们目前的监测水平是不够的,落后于其他国家。我们需要一个更全面的国家SARS-CoV-2基因组监测项目来解决这个问题。”

B.1.1.7 Variant于去年南部出现,自从u.k.2月份成为U.K.的主导变体以来,San Diego在加利福尼亚大学的同事的Scripps研究中获得了Scrips的第一个证据证实了加利福尼亚州的第一个证据。

占优势的模式

B.1.1.7变体含有几种突变,包括编码病毒刺蛋白的基因中的几种突变。这些突变增加了穗状体与人体细胞上的ACE2受体结合的能力。虽然没有证据表明B.1.1.7变体可以避开Covid-19疫苗,官员担心其相对较高的差距将在疫苗可以结束之前显着恶化。

标准棉签测试检查病毒基因组上三个位点的独特基因序列;由于B.1.1.7的突变,其中两个位点呈阳性,但第三个位点呈阴性,这是在病毒的刺突基因内。

自2020年7月以来,对大约50万份Helix测试结果的新分析显示,这种三分之二模式,即所谓的s基因靶失败,或SGTF,在10月中旬以较低的频率(0.2%)持续明显。到2月的第三周,它已经上升到10.6%的频率,并且在美国25个州和地区的患者中被检测到。

这种SGTF模式也可能发生在其他具有突峰基因突变的SARS-CoV-2变种中,但研究人员通过对他们从12月到2月的每个SGTF样本进行测序发现,在986个样本中有662个(67%)含有B.1.1.7变种。这表明,拭子试验中的SGTF模式可以提供B.1.1.7流行率的快速粗略指标。

Variant进入这个国家很多次

分析还表明,B.1.1.7自12月以来占SGTF结果的迅速上升 - 例如,在1月中旬达到加利福尼亚州的约95%。除了通过SGTF方法检测到的659 B.1.1.7案例外,研究人员发现了另外三种B.1.1.7变异的样品,作为加利福尼亚州的非偏见SARS-COV-2基因组监测努力的一部分。

该研究中测序的662例B.1.1.7病例来自美国10个州的样本,不过研究人员指出,覆盖美国33个州和地区的其他检测实验室到目前为止已经向CDC报告了至少一例B.1.1.7病例。

研究人员对检测到的B.1.1.7序列进行的家族树型分析显示,该变异至少从2020年11月下旬以来已多次被引入美国,尤其是在加利福尼亚州和佛罗里达州,而且在旅行增加的时期,包括感恩节这一周。

科学家们还发现,总体而言,这种病毒的传播速度似乎比以前占主导地位的SARS-CoV-2病毒的传播速度快40- 50%。他们估计,到2021年2月的第一周,B.1.1.7占美国COVID-19病例的4.3%,其中加利福尼亚州占4.2%,佛罗里达州约占11.5%。

更多信息:Nicole L. Washington等人,SARS-CoV-2 B.1.1.7在美国的出现和快速传播,细胞(2021)。DOI:10.1016 / J.Cell.2021.03.052

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